Yazar "Güngör, Tuğba" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 8 / 8
  • Küçük Resim
    Öğe
    Microwave assisted, sequential two-step, one-pot synthesis of novel imidazo[1,2-a] pyrimidine containing tri/tetrasubstituted imidazole derivatives
    (TUBITAK, 2021) Güngör, Tuğba
    A series of novel imidazo[1,2-a]pyrimidine containing tri/tetrasubstituted imidazole derivatives (1-10) has been synthesized via sequential two-step, one-pot, multicomponent reaction using imidazo[1,2-a]pyrimidine-2-carbaldehyde, benzil, primary amines, and ammonium acetate catalyzed by p-toluenesulfonic acid under microwave-assisted conditions. The results showed that target compounds can be obtained from a wide range of primary amines bearing different functional groups with moderate to good yields (46%-80%) under optimum reaction conditions. This method provides a green protocol for imidazo[1,2-a]pyrimidine containing tri/ tetrasubstituted imidazole derivatives due to ethyl alcohol as a green solvent, microwave irradiation as a greener heating method and one-pot multicomponent reaction as a green technique. The synthesized compounds have been elucidated using various spectroscopic tools such as FT-IR, 1 H NMR, 13C NMR, and MS.
  • Küçük Resim
    Öğe
    New nimesulide derivatives with amide/sulfonamide moieties: Selective COX-2 inhibition and antitumor effects
    (Elsevier Masson s.r.l., 2021) Güngör, Tuğba; Özleyen, Adem; Yılmaz, Yakup Berkay; Siyah, Pınar; Ay, Mehmet; Boyuneğmez Tümer, Tuğba
    Seventeen new amide/sulfonamide containing nimesulide derivatives were synthesized and characterized by several spectroscopic techniques and primarily investigated for their inhibitory potential on COX enzymes and other pro-inflammatory factors. Experimental analyses showed that among seventeen compounds, N8 and N10 have remarkable potency and selectivity for the COX-2 enzyme over COX-1 at very low doses as compared to nimesulide. Moreover, both N8 and N10 selectively reduced the Lipopolysaccharide (LPS)-stimulated COX-2 mRNA expression level while the COX-1 level remained stable. Both PGE2 release and nitric oxide production in macrophage cells were significantly suppressed by the N8 and N10 treatment groups. In silico ADME/Tox, molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations were also conducted. Additionally, all compounds were also screened in a panel of cancer cell lines for their antiproliferative properties by MTT and SRB assays. Compound N17 exhibited a considerable antiproliferative effect on the colon (IC50: 9.24 μM) and breast (IC50: 11.35 μM) cancer cell lines. N17 exposure for 48 h decreased expression of anti-apoptotic protein BCL-2 and increased the expression of apoptogenic BAX. Besides, the BAX/BCL-2 ratio was increased with visible ultrastructural changes and apoptotic bodies under scanning electron microscopy. In order to investigate the structural and dynamical properties of selected hits on the target structures, multiscale molecular modeling studies are also conducted. Our combined in silico and in vitro results suggest that N8 and N10 could be further developed as potential nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), while cytotoxic N17 might be studied as a potential lead compound that could be developed as an anticancer agent.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Nitroredüktaz esaslı kanser tedavisine yönelik aromatik ve heterosiklik ilaç-öncü bileşiklerin geliştirilmesi
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, 2016) Güngör, Tuğba; Ay, Mehmet
    Bu tez çalışmasında; kanser tedavisinde, gen yönlendirilmiş enzim ilaç öncü bileşik yaklaşımında kullanılacak, CB 1954 bileşiğinden daha etkili olması beklenen, nitro işlevsel grubu içeren aromatik ve/veya heterohalkalı bileşiklerin sentezi ve enzimatik uygulamaları araştırılmıştır. Araştırmanın ilk bölümünde, nitro işlevsel grubu içeren farklı iskelet yapıya sahip bileşik sınıflarının sentezi gerçekleştirilmiş ve yapıları çeşitli spektroskopik yöntemlerle aydınlatılmıştır. Nitro grubu içeren modifiye bir prolin sülfonamit katalizörü sentezlenerek YamadaOtani reaksiyonlarındaki kullanımı araştırılmıştır. Bununla birlikte, doğal bir ürün olan, viridinin nitro türevinin (11-29) çok basamaklı sentezinde belli aşamaya kadar gelinmiştir. Araştırmanın ikinci bölümünde, sentezlenen ilaç öncü bileşiklerin iki farklı nitroredüktaz enzimi (Ssap-NtrB ve Gk-Ntr) ile etkileşimleri HPLC analizi ile incelenmiştir. Enzimlerle yüksek oranda etkileşime giren substratların kararlı hal kinetik deneyleri, Michaelis-Menten parametreleri (KM ve Vmax) üzerinden yapılmıştır. Tüm deneysel veriler değerlendirildiğinde, 1d, 2d, 2e ve 2k substratlarının Ssap-NtrB ve Gk-Ntr birleşimlerinin, GDEPT (Gen Yönlendirilmiş Enzim-İlaç Öncü Tedavisi) temelli kanser tedavisine yönelik potansiyel enzim-ilaç öncü birleşimleri olarak kullanılabilecekleri düşünülmektedir.
  • [ X ]
    Öğe
    Preparation of novel imidazo[1,2-a]pyrimidine derived schiff bases at conventional and microwave heating conditions
    (2020) Güngör, Tuğba
    In this study, novel imidazo[1,2-a]pyrimidine derived schiff bases were synthesized via imine formation reaction and characterized with various spectral analysis such as FT-IR, 1H NMR, 13C NMR and MS. In addition to conventional heating reactions, microwave-assisted synthesis was applied to the C=N bond formation step. The reactions were carried out at reflux temperature in toluene and magnesium sulfate as drying agent. While final products were obtained at 10-36 h reaction times with moderate to good yields at conventional heating conditions, synthesized at 45-120 min reaction times with good yields at microwave heating conditions. Results showed that microwave-assisted synthesis which is a well-known green process for the synthesizing organic molecules provides to obtain shorter reaction times and higher yields in our study.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Prodrugs for Nitroreductase Based Cancer Therapy-5: Development of Trinitroaniline Prodrugs/Ssap-NtrB Combinations for Liver Cancer Using Intracellular and Extracellular Conditions
    (John Wiley and Sons Inc, 2021) Hacıoğlu, Nelin; Güngör, Tuğba; Tokay, Esra; Ay, Mehmet
    In this study, a series of trinitroaniline derivatives (TNA1-8) were synthesized and investigated as potential antitumor agents for enzyme-prodrug therapy. Enzymatic efficiency of Ssap-NtrB on prodrug candidates was determined with HPLC analysis and kinetic studies. The anti-proliferative properties of compounds were determined against four cancer cell lines (Hep3B, PC3, HT-29, and Saos-2) and a healthy cell line (HUVEC) via MTT assay. Intracellular and extracellular prodrug-enzyme treatments were carried out on Hep3B cells. Herewith, the expression of the Ssap-NtrB gene was confirmed with this study. IC50 values of piperidine and 1,3-cyclohexyl derivatives (TNA4 and TNA7) were identified as 1.724 nM and 1.640 nM at extracellular conditions. In intracellular conditions, it was determined as 0.293 μM and 0.393 μM, respectively. In summary, 2,4,6-trinitroaniline derivatives, especially compounds TNA4 and TNA7 might be used as prodrug candidates along with Ssap-NtrB for hepatocellular carcinoma therapy and the development of new prodrugs at cancer treatments.
  • [ X ]
    Öğe
    Synthesis of SMZ derivatives and investigation of effects on germination, root, and plant growth of Arabidopsis thaliana L.
    (Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2019) Güngör, Tuğba; Cömert Önder, Ferah; Sezer, Fatih; Özbilen, Aslıhan; Taşkın, Kemal Melih; Ay, Mehmet
    A series of sulfonamide derivatives were synthesized by reactions with various functional groups containing benzenesulfonyl chlorides and aniline derivatives under different substitution reaction conditions. The structures of SMZ derivatives were confirmed with melting point, FT-IR, H-1 NMR, C-13 NMR, and LC-MS/MS techniques. In order to investigate the cytotoxic effects of these derivatives, we used a model plant species. The synthesized compounds (S1-S5) and sulfamethazine (SMZ) as a positive control were applied to Arabidopsis thaliana seeds. Our results indicated that S3 and S4 induced shorter roots and lower wet weight in plants. Plants treated with S2 and S5 showed no growth effects, similar to the untreated control group, while S1 slightly reduced root length and wet weight. These results suggest that S3 and the newly synthesized S4 derivatives have potential for use as herbicides since they possess cytotoxic effects on A. thaliana plants.
  • [ X ]
    Öğe
    Synthesis, Spectroscopic Characterization, Crystal Structure and Theoretical Studies on New Organic Single Crystal of 1-(3,5-Difluorophenyl)-3-(2-Nitrophenyl)Urea
    (2021) Güngör, Tuğba; Karakurt, Tuncay; Şahin, Zarife Sibel
    A new organic compound, 1-(3,5-difluorophenyl)-3-(2-nitrophenyl)urea was synthesized from 2-nitroaniline, 3,5-difluoroaniline and triphosgene in sequential two steps with 92% yield. The product was crystallized by the slow evaporation using THF and ethyl acetate solvent system to obtain its single crystal. The pure crystals were characterized with melting point, FT-IR, 1H NMR, 13C NMR and MS. The structure of the compound was brought to light by X-ray single-crystal structure determination. Density functional theory calculations were applied by using (DFT/B3LYP) method with the 6-311G(d,p) basis set level. The potential energy surface (PES) scanning was performed to determine the stability of the molecule. Frontier molecular orbitals of the compound were calculated. AIM charge and MEP analyzes were performed.
  • [ X ]
    Öğe
    Yeni Nesil Anti-Inflamatuar Moleküllerin In-Siliko Tasarımı, Sentezi, Etkinlik Taraması Ve İkincil Antikarsinojenik Özellikleri Ile Mekanizmalarının Aydınlatılması
    (2022) Tümer, Tuğba; Güngör, Tuğba; Ay, Mehmet; Özleyen, Adem; Yılmaz, Yakup Berkay
    İnflamasyon, canlı organizmaların patojenler, hasarlı hücreler veya kötü yaşam koşulları gibi zararlı uyaranlara karşı gösterdiği doğal bir bağışıklık tepkisidir. Uzun süreli inflamasyon artrit, diyabet, astım gibi hastalıkların ortaya çıkması ile ilişkilidir. Bu nedenle, kronik inflamasyonun inhibisyonu çeşitli hastalıklar için alternatif bir terapötik ve önleyici strateji olabilir. Steroid olmayan antiinflamatuar ilaçlar (NSAİİler), çoğunlukla siklooksijenaz (COX) ve lipooksijenaz (LOX) yolakları üzerindeki etkileri nedeniyle inflamasyona karşı iyi bilinen ve yaygın olarak kullanılan ilaç sınıfıdır. Son birkaç yıldır, NSAİİler antikanser etkinlikleri ile de dikkat çekmiştir. Ancak, NSAİİlerin uzun süreli kullanımı, kardiyovasküler bozukluklar ve gastrointestinal hasar dahil olmak üzere birçok rahatsızlığa yol açmaktadır. Bu olumsuzluklardan dolayı etki gücü yüksek ve daha az yan etkiye sahip yeni nesil bileşiklerin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Bu çalışmamızda COX, 5-LOX, iNOS hedefleri ile etkileşen, birden fazla biyolojik molekülü aynı anda hedef alan etki gücü yüksek, aynı zamanda hücre koruyucu etkisi olan gaz salıcılar veya doğal ürün türevleri ile yan etkisi düşük yeni nesil anti-inflamatuar ilaç etken molekülleri belirlenmiş ve in siliko (parça temelli) tekniklerle tasarlanmıştır. Tasarlanan bileşikler yeni yaklaşımlar kullanılarak sentezlenmiş, saflaştırılmış ve yapıları aydınlatılmıştır. Tekrarlayan in siliko, sentez ve in vitro çalışmalar ile en etkin, çok hedefli antiinflamatuar ve antikanserojenik ilaç öncül adayları belirlenmiştir. Buna göre Nimesulid türevi bileşikler grubunda iki özgün bileşik (N8 ve N10) güçlü antiinflamatuar etkinlik gösterirken yine bu grupta yer alan özgün N17 bileşiği meme ve kolon kanseri hücre hatlarında iyi derecede antikanserojenik etki sergilemiştir. Tüm H2S salan bileşikler arasında, iki özgün bileşik (S6 ve S8) antikanserojenik özllikleri ile ön plana çıkmış, izotiyosiyanat türevi bileşiklerde ise I1den türeyen bileşiklerde yüksek antiinflamatuar aktivite ve antikanserojenik aktivite gözlemlenmiştir. Ayrıca, H2S salan bileşikler ile izotiyosiyanat türevlerinin tümü, 4 saatlik süreç boyunca tercih edilen salınım olan yavaş H2S salınımı göstermiştir. Bu sonuçlar bilinen ve hem nutrosötik hem de farmasötik özellikleriyle dikkat çeken sülforafan ve moringin gibi doğal izotiyosiyanatlar ile uyumlu ve hatta daha iyi sonuçlar göstermiştir. Özetle, özgün N8, N10, I1a, I1b, I1c, I1d ve I1e bileşiklerinin potansiyel antiinflamatuar ajanlar ve N17, S6, S8, I1 ve I2 bileşiklerinin ise kanser tedavisi ve önlenmesi için umut vadeden antikanser ajanları olarak daha ileri çalışmalar gerektirdiği sonucuna varılmıştır. Ekibimiz tarafından, bu bileşiklerin in siliko rehberli çalışmalar doğrultusunda türevlendirilmesi ve klinik öncesi in vivo çalışmalar gerçekleştirmek üzere ilaç şirketleri ile ortak, yeni, öncelikli alan ARGE projelerinin geliştirilmesi üzerine çalışmalarımız devam etmektedir.