Çanakkale ve Tekirdağ İlleri Kanola Üretim Alanlarında Önemli Virüs Hastalıklarının Tanılanması ve Karakterizasyonu

Amaç: Bu çalışma Çanakkale ve Tekirdağ illeri kanola üretim alanlarındaki bazı virüshastalıklarının tespiti ve moleküler karakterizasyonu amacı ile yürütülmüştür.Materyal ve Metot: Kanola bitkileri görsel olarak incelenmiş, virüs ve virüs-benzerisimptom gösteren bitkilerden örnekler toplanmıştır. Toplanan örnekler turnip mosaicvirus (TuMV), cucumber mosaic virus (CMV) ve cauliflower mosaic virus (CaMV)’ünvarlığının belirlenmesi amacı ile DAS-ELISA ile testlenmiştir. Enfekteli bulunanlariçerisinden her bir virüs için 2 izolat seçilerek RT-PCR ile istenilen gen bölgeleri kısmiolarak çoğaltılmış, klonlanmış ve dizilenmiştir. Elde edilen dizileme verileri kullanılarakçoklu dizi ve filogenetik analizler gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Testlemeler sonucunda 16 örnek TuMV ile 3 örnek ise CMV ile enfekteliolarak bulunmuştur. Bir örnekte ise CMV ve TuMV karışık enfeksiyonu tespit edilmiştir.Toplanan örneklerin hiçbirisinde CaMV enfeksiyonuna rastlanılmamıştır. İzolatlarınmoleküler karakterizasyonları sonucunda TuMV izolatlarının dünya izolatları ile %80-94 ve 90-98, CMV izolatlarının ise %77-98 ve 82-100 oranında sırası ile nükleotit veamino asit düzeyinde benzerlikler gösterdiği tespit edilmiştir. Filogenetik analizlersonucunda ise TuMV izolatlarının Asian BR ve CMV izolatlarının ise IA gruplarında yeraldığı belirlenmiştir.Sonuç: Gerçekleştirilen bu çalışma ile kanola üretim alanlarında TuMV ve CMVenfeksiyonu tespit edilerek çoğaltılan kısmi gen bölgeleri moleküler olarak karakterizeedilmiştir.