Çanakkale ve Tekirdağ İlleri Kanola Üretim Alanlarında Önemli Virüs Hastalıklarının Tanılanması ve Karakterizasyonu
[ X ]
Tarih
2020
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Amaç: Bu çalışma Çanakkale ve Tekirdağ illeri kanola üretim alanlarındaki bazı virüshastalıklarının tespiti ve moleküler karakterizasyonu amacı ile yürütülmüştür.Materyal ve Metot: Kanola bitkileri görsel olarak incelenmiş, virüs ve virüs-benzerisimptom gösteren bitkilerden örnekler toplanmıştır. Toplanan örnekler turnip mosaicvirus (TuMV), cucumber mosaic virus (CMV) ve cauliflower mosaic virus (CaMV)’ünvarlığının belirlenmesi amacı ile DAS-ELISA ile testlenmiştir. Enfekteli bulunanlariçerisinden her bir virüs için 2 izolat seçilerek RT-PCR ile istenilen gen bölgeleri kısmiolarak çoğaltılmış, klonlanmış ve dizilenmiştir. Elde edilen dizileme verileri kullanılarakçoklu dizi ve filogenetik analizler gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Testlemeler sonucunda 16 örnek TuMV ile 3 örnek ise CMV ile enfekteliolarak bulunmuştur. Bir örnekte ise CMV ve TuMV karışık enfeksiyonu tespit edilmiştir.Toplanan örneklerin hiçbirisinde CaMV enfeksiyonuna rastlanılmamıştır. İzolatlarınmoleküler karakterizasyonları sonucunda TuMV izolatlarının dünya izolatları ile %80-94 ve 90-98, CMV izolatlarının ise %77-98 ve 82-100 oranında sırası ile nükleotit veamino asit düzeyinde benzerlikler gösterdiği tespit edilmiştir. Filogenetik analizlersonucunda ise TuMV izolatlarının Asian BR ve CMV izolatlarının ise IA gruplarında yeraldığı belirlenmiştir.Sonuç: Gerçekleştirilen bu çalışma ile kanola üretim alanlarında TuMV ve CMVenfeksiyonu tespit edilerek çoğaltılan kısmi gen bölgeleri moleküler olarak karakterizeedilmiştir.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Viroloji, Ziraat Mühendisliği, Bitki Bilimleri
Kaynak
Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
57
Sayı
1
