Yazar "Ertürk, Murat" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 12 / 12
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Accurate Thermochemistry with Multireference Methods: A Stress Test for Internally Contracted Multireference Coupled-Cluster Theory(American Chemical Society, 2024) Waigum, Alexander; Ertürk, Murat; Koehn, AndreasThe internally contracted multireference coupled-cluster method with single, double and perturbative triple excitations, icMRCCSD(T), was tested for its performance in the context of computational high-accuracy thermochemistry. The results were gauged against the standard single-reference coupled-cluster hierarchy with up to 5-fold excitations. The test set comprised of a selection of first-row dinuclear compounds and the three 3d-transition metal compounds MnH, FeH, and CoH. The results revealed two problems with the current formulation of icMRCCSD(T). First, the choice of the Dyall Hamiltonian as the zeroth-order Hamiltonian, which leads to a biased description of the different orbital subspaces and particularly poor results for the atomic correlation energies, and second, the tendency to overestimate the perturbative correction for triply excited clusters, in particular in the presence of open shells and correspondingly low orbital-energy gaps. The two problems could be solved by resorting to the effective Fock operator as zeroth-order Hamiltonian and by adopting a modified amplitude equation that includes terms quadratic in the pair clusters. A similar modification was recently proposed by Masios et al. (Phys. Rev. Lett. 2023, 131, 186401) in the context of applying single-reference coupled-cluster theory to systems with small or vanishing band gaps and we chose the acronym '(cT*) correction' in analogy to that work. In contrast to the work of Masios et al., additional terms including single excitation clusters were omitted, as these again lead to an overestimation of correlation effects in more difficult cases. We also tested another alternative for the zeroth-order Hamiltonian and additional higher-order corrections for the correlation energy. These extensions did not significantly improve the results and were also computationally more demanding. The improved icMRCCSD(cT*)F method yields very accurate results with errors, relative to accurate benchmarks, better than 2 kJ/mol for total energies and atomization energies for the entire set of examples considered in this work.Öğe Applicability of noninteger bessel type orbital basis sets: numerical and analytical approaches(Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, 2023) Coşkun, Mahmut; Ertürk, MuratRecently, usefulness of the noninteger principal quantum numbers for Bessel type orbitals was discussed by Weniger in (Adv Quant Chem 83:209–237, 2021). In this study, we analyzed the applicability and numerical accuracy of basis sets of noninteger Bessel type orbitals to electronic structure calculations. Both numerical and analytical approaches are applied to two-electron atomic systems. The results of the numerical test demonstrated the potential of the noninteger values of principal quantum number for the improving of Bessel type functions approach in use of LCAO methods. Nevertheless, the analytical approach is still not suitable and in development and needs to be investigated further.The performance of the presented basis functions is also compared to the numerical Hartree–Fock results.Öğe ATOMLARA AİT MULTİPLET TABLOLARININ KUANTUM MEKANİKSEL YOLLA YENİLENMESİ(2007) Demircan, Osman; Guseınov, İsrafil Hüseyin; Mehmedov, Bahtiyar; Özdemir, Sacit; Ertürk, Murat; Ektiren, YazyaMultiplet (çokkatlılık) tabloları, deneysel/gözlemsel atom tayflarının sınıflandırılmasında ve çizgi tanılarının yapılmasında büyük önem taşırlar (bkz. Moore 1950, 1959, 1971). Bu tablolar, atomların elektronik enerji geçişlerine karşılık gelen frekanslar yanında, çizgiye ait multiplet numarası, geçiş olasılığı, çizgi şiddeti gibi nicelikleri de içermektedir. Şimdiye kadar litaratürde yayınlanmış bu türdeki tablolar (örn. Adelman et al. 1995, Adelman 1992, Nave et al. 1994), deneysel veya yarı-deneysel yolla oluşturulmuştur. Bu tablolar atom ve iyon çeşitliliği ve içerdiği veri bakımından ihtiyaca tam olarak cevap verememektedir. Bu nedenlerden dolayı, çok sayıda atom ve iyon içeren, eksiksiz bir multiplet tablosuna gereksinim vardır. Bu projenin amacı, tamamiyle teorik formüllere dayalı olarak (bkz. Guseinov 1998a), bu tabloları yeniden oluşturarak, bilim dünyasının hizmetine sunmaktır. Bu araştırmada kullanılacak teorik hesaplama yöntemi şu şekilde özetlenebilir: Kapalı ve açık elektron kabuklarına sahip atomlar ve iyonlar için Hartree-Fock-Roothaan (HFR) yönteminin yeni denklemleri literatürde mevcuttur (Guseinov 1998a). Bu denklemlerin çözülmesi ve sistemin fiziksel özelliklerinin incelenmesi için önemli bir temel oluşturan “Slater tipi orbitaller” (STO)’den yararlanılır. STO’larla yapılan işlemlerde oldukça karmaşık matematiksel ve sayısal hesaplamalar vardır. Bu hesaplamalar, büyük boyutlu matrislerin yeni teoremler (Guseinov 1998b) yardımıyla çözülmesi sonucunda yapılabilmektedir. Bugüne kadar yapılan çalışmalarda, STO’ları içeren tüm matris elemanları için, üstel yapıdaki tam ortanormal orbitallerden yararlanılarak analitik ifadeler elde edilmiştir (Guseinov 2002, 2003ab). Bu ifadeler atom orbitallerinin keyfi kuantum sayıları ve keyfi perdeleme sabitleri için geçerlidir. Diğer bir deyimle bu çalışmada kullanılan HFR yönteminin yardımı ile, keyfi kapalı ve açık elektron kabuklarına sahip atomların multiplet enerjileri hesaplanacaktır. Teorik hesaplamalardan bulunan sonuçlar deneysel değerlerle karşılaştırılacaktır.Öğe Bazı çok elektronlu atomların multiplet enerji çiftlenim-izdüşüm katsayılarının hesaplanması(Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2004) Ertürk, Murat; Demircan, OsmanÖZ Çok elektronlu atomların-iyonların özellikleri çeşitli yaklaşım yöntemleri kullanılarak incelenir. Bunlardan, günümüzde yaygın olarak kullanılanı Hartree-Fock yöntemidir. Bu yöntemde 'serbest parçacıklar' modelinden faydalanılır. Bu modelde çok elektronlu atomların veya iyonların dalga fonksiyonu Slater determinantlarından oluşur. Determinantı oluşturan tek elektronlu dalga fonksiyonları, enerji formülünde determinant dalga fonksiyonlarına göre varyasyon hesabı yapılarak bulunur. Çok elektronlu atomların veya iyonların multiplet terimlerinin enerjisi için determinant dalga fonksiyonlarına göre matris elemanları hesaplanmaktadır. Multiplet terim eneıjilerinin belirlenmesinde Guseinov (1998a) tarafından önerilen yöntem kullanılarak çiftlenim-izdüşüm katsayıları hesaplanmıştır. Anahtar kelimeler; Perdelenmiş Alan Yaklaşımı, Determinant Dalga Fonksiyonu, Çok Elektronlu Operatörler ve Matris Elemanları, Hartree-Fock Yöntemi, Çiftlenim- izdüşüm Katsayıları, Multiplet Terimlerin Enerjisi.Öğe Calculation of negative ions of B, C, N, O and F using noninteger n Slater type orbitals(Chinese Chemical Soc, 2008) Guseinov, İsrafil İsa; Ertürk, Murat; Şahin, Ercan; Aksu, Hüseyin; Bağcı, AliCombined Hartree-Fock-Roothaan calculations have been performed using noninteger n Slater type orbitals for the ground states of the lowest electron configurations 1s(2)2s(2)2p(n) (2 <= n <= 6) for negative ions of B, C, N, O and F. These results are compared with the corresponding results obtained from the use of integer n Slater type orbitals. All of the nonlinear parameters are fully optimized. The results of calculation of coupling-projection coefficients, orbital and total energies and virial ratios are presented. It is shown that the noninteger n Slater type orbitals, in general, improve the orbital energies.Öğe Exponential type orbitals with hyperbolic cosine function basis sets for isoelectronic series of the atoms Be to Ne(Walter De Gruyter Gmbh, 2023) Şahin, Ercan; Ertürk, Murat; Özdoğan, Telhat; Orbay, MetinExponential type orbital with hyperbolic cosine basis functions, proposed recently for Hartree-Fock-Roothaan calculations of neutral atoms, are studied in detail for the calculations of isoelectronic series of atoms from Be to Ne. Calculations are performed for the neutral and the first 20 cationic members of the isoelectronic series of each atom in its ground state. Three of the most popular exponential type orbitals (Slater type functions, B functions and psi((alpha) )functions with alpha = 2) are combined with modified hyperbolic cosine function cosh(beta r + gamma) to improve the basis function quality within the minimal basis sets framework. Performances of the basis functions are compared with each other by using the same number of variational parameters in them. The obtained results are also compared with numerical Hartree-Fock and extended Slater type basis set results. The presented accuracy of the minimal basis descriptions of atomic systems supports the usage of these unconventional basis functions in electronic structure and property calculations.Öğe Generalized complete orthonormal sets of Exponential-Type functions(Elsevier B.V., 2023) Demirdak, Gürkan; Ertürk, Murat; Şahin, ErcanNew generalized complete orthonormal sets of ψα-exponential type functions are described and applied to LCAO calculations for the total energies of atomic systems within the framework of the minimal basis sets approximation in combined Hartree-Fock-Roothaan method. A new variational parameter μ is proposed in the complete orthonormal sets of ψα-exponential type functions where α∗ parameter changes in the range -∞<α∗<3. The combined Hartree-Fock-Roothaan calculations have been performed to determine the performance of new basis sets. The comparison has been made by the use of different generalized exponential type basis sets used in the literature. The optimal values of parameters are determined by minimizing the total energies. According to obtained total energy results, the ψα basis sets are more effective than standard definition of ψα basis sets and there is no restriction on α∗ values studied systems in this work.Öğe Hartree-fock-roothaan kuramında kesirli baş kuantum sayılı orbitaller kullanılarak atom özelliklerinin incelenmesi(Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2011) Ertürk, Murat; Hüseyin, İsrafilBu çalışmada, bazı çok elektronlu atomların temel durum enerjisi, orbital enerjileri, virial oranı gibi özellikleri, Hartree-Fock-Roothaan kuramının yeni önerilen denklemlerine dayalı olarak, hiperbolik kosinüs ve genelleştirilmiş üstel tipli fonksiyonların birleşiminden oluşan baş kuantum sayısı kesir değerli yeni baz fonksiyonları kullanılarak hesaplandı.Tez çalışması iki bölüme ayrılarak yapıldı. Birinci bölümde, Hartree-Fock-Roothaan yönteminde yeni önerilen denklemlerin atomlar için analitik formülleri elde edildi. Bu formüller kullanılarak açık ve kapalı kabuklu atomlar için Hartree-Fock-Roothaan denklemlerinin genel programı yapılmıştır. Bu program kullanılarak atomların elektronik özellikleri için hesaplamalar yapıldı. Bu hesaplamalarda, baş kuantum sayısı kesir değerli baz fonksiyonları atom numaralarına göre incelendi.İkinci bölüm çalışmalarında, literatürde bulunan baz fonksiyonları incelenerek daha etkin iki yeni baz fonksiyonu önerildi. Bu fonksiyonlar kullanılarak atomlar için toplam enerji hesaplama sonuçları elde edilip, literatürdeki benzer fonksiyonların sonuçları ile karşılaştırıldı. Yeni önerilen baş kuantum sayısı kesir değerli baz fonksiyonları kullanılarak denklemlerin analitik çözümü yapıldı ve bu fonksiyonların atomik hesaplamalardaki etkinlikleri literatürdeki diğer benzer çalışmalarla karşılaştırılarak incelendi.Atom özelliklerinin belirlenmesindeki en önemli problemlerden biri de kullanılan baz fonksiyonlarındaki ?en uygun? parametrelerin belirlenmesidir. Yapılan programlar aracılığıyla, toplam enerjinin minimum olması şartına bağlı olarak optimizasyon ile tüm parametreler elde edildi.Elde edilen tüm sonuçlar, literatürde bulunan diğer sonuçlarla karşılaştırılarak Hartree-Fock-Roothaan yönteminde yeni denklemlerinin kullanılabileceği durumlar gösterilmiş ve önerilen baz fonksiyonlarının etkinliği belirlenmiştir.Öğe İki Elektronlu Atomik Sistemler için Baş kuantum Sayısı Kesir Değerli Bessel Tipli Orbitaller(Çanakkale Onsekiz Mart University, 2023) Coşkun, Meral; Ertürk, MuratBu çalışmanın amacı, baş kuantum sayısı tamsayı olmayan Bessel tipli orbitallerin Hartree-Fock-Roothaan yöntemi ile atomik sistemlere uygulanabilirliğini ve literatürdeki diğer üstel tipli orbitallerden üstünlüklerini incelemektir. Birleşik Hartree-Fock-Roothaan yönteminde yeni önerilen Bessel tipli orbitaller kullanılarak, iki elektronlu atomik sistemlerin orbital ve temel durum enerji değerleri hesaplanmıştır. Minimal baz çerçevesinde oluşturulan yeni baz fonksiyonları ile elde edilen değerler tablolarda karşılaştırmalı olarak verilmiştir. Elde edilen sonuçlar, literatürde kullanılan benzer üstel tipli baz fonksiyonlarına göre daha iyi değerler vermekte ve sayısal Hartree-Fock değerleri ile çok iyi uyum sağlamaktadır.Öğe Karotis endarterektomide karşı taraf karotis arter tıkanıklığı bir risk faktörü müdür?(2016) Reyhanoğlu, Hasan; Aşgün, Halil Fatih; Özcan, Kaan; Ertürk, Murat; Durmaz, İsaAmaç: Bu çalışmada karotis endarterektomi yapılan hastalarda karşı taraf karotis arter tıkanıklığının morbidite ve mortalite açısından ek risk oluşturup oluşturmadığı araştırıldı. Çalışma planı: Eylül 2010 - Mart 2015 tarihleri arasında kliniğimizde karotis darlığı tanısı ile ameliyat edilen toplam 135 hasta (103 erkek, 32 kadın; ort. yaş 68.3 yıl; dağılım 46-92 yıl) karşı taraf arterde tıkanıklık varlığına göre iki gruba ayrıldı. Endarterektomi uygulanan karotis arterinin karşı tarafında tıkanıklık olan 32 hasta ile karşı tarafında tıkanıklık olmayan 103 hasta ile karşılaştırıldı. Her iki grubun başlangıç demografik özellikleri, risk faktörleri, cerrahi teknik tipi, ameliyat sonrası erken dönem morbidite ve mortalite sonuçları karşılaştırıldı. Bulgular: Her iki grup demografik ve ameliyat sırası özellikler açısından benzerdi. Her iki grup arasında ameliyat sonrası hem nörolojik [karşı taraf karotis arterde oklüzyonu (CO) olan grup %6.3, kontrol grubu %6.8, p=0.638] hem nörolojik olmayan komplikasyon (CO grubu %15.6, kontrol grubu %12.6, p=0.430) açısından istatistiksel anlamlı fark saptanmadı. İki grupta da hastane kalış süresi arasında istatistiksel fark yok iken; tıkanıklık olan grupta yoğun bakım kalış süresi anlamlı uzun idi (p=0.029). Ameliyat sonrası mortalite açısından gruplar arasında (CO grubu %0, kontrol grubu %1, p=0.763) anlamlı fark saptanmadı. Sonuç: Karşı taraf karotis arter tıkanıklığı olan hastalarda serebral kan kaynağının sınırlı olması nedeniyle yüksek morbidite ve mortalite görüleceği düşünülse de özellikle ameliyat sonrası nörolojik komplikasyon açısından anlamlı bir artış görülmedi. Bu nedenle, karotis endarterektomisi uygulanacak hastalarda karşı taraf tıkanıklığının cerrahi açıdan ek bir risk oluşturmadığı kanaatindeyizÖğe The Role of Polar Functional Groups of the Special Pair on the Excites States in Terms of the Dielectric Environment: Screened Range Separated Time-Dependent Density Functional Theory(Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2025) Geçit, Fehime Hayal; Güneş, Zühra; Ertürk, Murat; Aksu, HüseyinWe study the role of polar functional groups (PFGs) on the excited states and the changes of net charges on the charge transfer (CT) states in terms of dielectric constant using ab initio theory. It is found that the PFGs play a dielectric medium in which the side PFGs interact strongly with the incoming light, and this interaction contributes to the wave function of excited states. Results reveal that conformer structure due to side groups has more influence on transition dipole moment (TDM) and thus on the electronic excitations. We have also discussed the well-known J- and H- aggregation physical phenomenon for the special pair and shown the excitonic splitting energies of the special pair compared to the monomer's first excited state energies. Excitation energies, oscillator strength, and CT states are obtained by using time-dependent density functional theory (TDDFT) and accompanying screened range-separated hybrid functionals (SRSH) in which comparisons are made with $\omega$B97X-D functional.Öğe Understanding Primary Charge Separation and Revealing Fermi's Golden Rule in the Heliobacterium Modesticaldum Reaction Center(Amer Chemical Soc, 2025) Ertürk, Murat; Güneş, Zühra; Aksu, HüseyinWe investigate the spectroscopic properties and charge transfer (CT) processes in the homodimeric reaction center of Heliobacterium modesticaldum (HbRC), for which we report the first-principles calculation of Fermi's golden rule (FGR) for the first time in the literature. HbRC is the simplest known analogue to other photosystems and consists of the SPP molecule, the adjacent Acc, and key amino acid residues (His537 and Gln458), along with two water molecules. We identify intrapair CT processes within the SPP molecule, which acts as the donor for the simplified model used in this study. We also examine the SPP+Acc- CT processes, where we demonstrate, in agreement with experimental findings, symmetric hole-electron delocalization across both Acc monomers. The calculated forward CT states are lower in energy than the bright states, facilitating electron transfer through a downhill CT reaction pathway. To explore the influence of surrounding molecular pigments on the electronic structure and FGR rate, we use augmented models incorporating nonsymmetrized molecular orientations. Most FGR rates are found to be on the order of picoseconds (ps). All electronic parameters are derived using an optimally tuned screened range-separated hybrid functional within a polarizable continuum model (SRSH-PCM), considering different dielectric constants.
