Yazar "Özleyen, Adem" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 7 / 7
  • Küçük Resim
    Öğe
    Biofortified Whey/Deglycosylated Whey and Chickpea Protein Matrices: Functional Enrichment by Black Mulberry Polyphenols
    (Springer, 2022) Özleyen, Adem; Çınar, Zeynep Özlem; Karav, Sercan; Bayraktar, Ayşe; Arslan, Ayşenur; Kayılı, H. Mehmet; Salih, Bekir; Boyuneğmez Tümer, Tuğba
    Morus nigra L. (black mulberry-BM) is a promising nutraceutical fruit containing biologically active polyphenols like anthocyanins, proanthocyanidins, catechins, and stilbenes, with well-established anti-inflammatory, antidiabetic, anti-obesity, and anticancer biofunctions. However, these health-promoting properties in raw fruit are greatly masked due to the presence of soluble and insoluble carbohydrates in excess amounts restricting daily intake of the required dose to achieve targeted effects. In the current study, different protein sources (defatted whey and chickpea flours) were optimized through different conditions to capture polyphenols from BM juice while diminishing its glucose content. To optimize polyphenol-protein interactions, various pHs (3.7, 4.2, and 4.7), matrix concentrations (20, 50, and 80 g protein/L), and incubation times (5, 20, and 45 min) were tested. In the present work, optimized BM polyphenol enriched whey matrix inhibited pro-inflammatory mediators and promoted Nrf-2 dependent cytoprotective enzyme expressions in lipopolysaccharide (LPS) induced macrophages at low doses. In addition, whey proteins were also subjected to an enzymatic deglycosylation process by using recently identified EndoBI-1 enzyme for the specific cleavage of N-glycan core in all glycan types including high mannoses, hybrids as well as complex glycans found on defatted whey proteins. After this process, the polyphenol sorption capacity of deglycosylated whey proteins was found to be significantly higher (37%) than the capacity of non-treated normal whey protein under optimized conditions. In conclusion, deglycosylation of protein matrices could be a novel strategy for efficient sorption/concentration of polyphenols from fruits and vegetables, however, more detailed studies are needed to understand this effect.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Dataset on the differentiation of THP-1 monocytes to LPS inducible adherent macrophages and their capacity for NO/iNOS signaling
    (Elsevier Inc., 2021) Özleyen, Adem; Yılmaz, Yakup Berkay; Boyuneğmez Tümer, Tuğba
    When THP-1 cells are differentiated into adherent macro-phage-like cells, they respond to inflammatory stimuli by changing their phenotypes to an activation state and altering the expression of inflammation-related genes. Nitric oxide (NO) is a diatomic molecule implicating in various pathological conditions including tissue damage, ER stress, obesity, and cancer. The sustained inflammatory microenvironment leads to increased NO release through the activation of the inducible nitric oxide synthase (iNOS) gene in macrophages. Here, we provide a dataset on the optimized conditions for the THP-1 differentiation and the induction of NO/iNOS signaling under inflammatory stimulus. The human monocytic cells were differentiated into adherent macrophage-like phenotype by phorbol-12-myristate-13-acetate (PMA) stimulation under optimized conditions. In this study, NO/iNOS signaling capacity and the regulation of other pro-inflammatory genes including TNF-α, IL-1β, and COX-2 in the LPS-induced THP-1 were examined.
  • [ X ]
    Öğe
    Elucidation of anti-inflammatory and anticancer properties of novel nimesulide derivatives
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2020) Özleyen, Adem; Tümer, Tuğba
    İnflamasyon, canlı organizmaların patojenler, hasarlı hücreler veya kötü yaşam koşulları gibi zararlı uyaranlara karşı doğal bir bağışıklık tepkisidir. Uzun süreli inflamasyon artrit, diyabet, astım gibi hastalıkların ortaya çıkması ile ilişkilidir. Bu nedenle, kronik inflamasyonun inhibisyonu çeşitli hastalıklar için alternatif bir terapötik ve önleyici strateji olabilir. Steroid olmayan anti-inflamatuar ilaçlar (NSAID'ler), güçlü analjezik ve anti-inflamatuar etkileri nedeniyle ilaç endüstrisinde en çok reçete edilen ilaç sınıfıdır. Etki mekanizmaları, siklooksijenaz (COX) enzim-aracılı prostaglandin üretiminin inhibisyonuna dayanır. Bununla birlikte, NSAID'lerin uzun süreli kullanımı kardiyovasküler, idrar ve gastrointestinal problem riskini artırır. Bu olumsuz etkilerin altında yatan sebep, istenmeyen COX-1 enzim inhibisyonudur. Daha ileri çalışmalar, COX-2 enzimini inhibe ederken COX-1 enzimini sınırlı bir oranda inhibe eden öncelikli COX inhibitörlerinin, geleneksel NSAID'lere kıyasla güvenli terapötikler olabileceğini göstermiştir. İkincil neden, araşidonik asit metabolizmasında homeostazın lipooksijenaz (LOX) yollarına doğru bozulmasıdır. 5-LOX, inflamatuar yanıtta rol oynayan başka bir enzimdir. 5-LOX yolağının aktivasyonu, gastrointestinala zarar veren aşırı miktarda lökotrien üretimine yol açar. Nimesulid, anti-inflamatuar, analjezik ve antipiretik etkilere sahip kanıtlanmış öncelikli COX-2 inhibitörlerden birisidir. Nimesulidin terapötik etkisi, pro-inflamatuar prostaglandin ve sitokin üretimlerinin inhibisyonuna dayanır. Bu farmakolojik etkilerin dışında, nimesulid reaktif oksijen türleri (ROS), nitrik oksit (NO) ve lökotrien B4 (LTB4) seviyelerini de azaltır. Ayrıca, nimesulid kanser hücrelerinin çoğalmasını, serebral iskemiyi ve NSAID'lerin neden olduğu ülseri inhibe eder. Bu çalışmada amid/sülfonamid içeren on yedi adet yeni nimesulid türevlerinin anti-inflamatuar ve antikanser etkilerinin aydınlatılması amaçlanmıştır. Bu amaçla bütün bileşikler COX-2/COX-1 enzim aktivitesi üzerine etkileri açısından taranmıştır. Buna göre, N8 ve N10 bileşikleri, referans ilaç nimesulid ile karşılaştırıldığında COX-2 enzimi üzerinde daha iyi seçicilik göstermiştir. Ayrıca, hem N8 hem de N10, LPS ile uyarılan COX-2 mRNA ekspresyon seviyesini seçici olarak düşürürken, COX-1 seviyesi makrofajlarda stabil kalmıştır. Makrofaj hücrelerinde hem PGE2 salımı hem de nitrik oksit üretimi N8 ve N10 uygulama grubunda önemli ölçüde baskılanmıştır. Ayrıca bu iki bileşik, IL-l? ve TNF-? seviyesini istatistiksel olarak anlamlı ölçüde düşürmüştür. Türevlerin antikanser özelliklerini belirlemek için yapılan tarama çalışmalarına göre, N17 bileşiği kolon (IC50: 9.24 µM) ve meme (IC50: 11.35 µM) kanser hücresi hatlarında önemli sitotok özellik sergiledi. Özetle, bu sonuçlar N8 ve N10 bileşiklerinin umut verici anti-inflamatuar ajanlar olabileceğini, sitotoksik N17 bileşiği ise daha sonraki potansiyel antikanser ilaç gelişimi öncüsü olarak çalışılabileceğini göstermektedir.
  • [ X ]
    Öğe
    GR24, a synthetic analog of Strigolactones, alleviates inflammation and promotes Nrf2 cytoprotective response: In vitro and in silico evidences
    (Elsevier Sci Ltd, 2018) Boyuneğmez Tümer, Tuğba; Yılmaz, Berkay; Özleyen, Adem; Kurt, Begüm; Taşkın Tok, Tuğba; Taşkın, Kemal Melih; Savranoğlu Kulabaş, Seda
    Naturally occurring phytohormones have shown distinguished potential in chemoprevention and treatment of chronic inflammatory diseases in mammalian cells. Strigolactones (SLs) are a class of carotenoid-derived lactones regulating many aspects of plant development and recently recognized as phytohormones with promising anticancer activity. In this study, GR24, a synthetic analog and representative of SLs, induced the expression of phase II detoxifying enzymes such as HO-1 and NQO1 in hepatic and macrophage cell lines under normal and inflammatory conditions, respectively. This effect has been found to be mediated by Nrf2 activation. In silico molecular docking against 16-mer peptide binding site on Keapl suggested that GR24 may exert its biological activity by interfering with Keapl and Nrf2 binding. GR24 also displayed remarkably potent inhibitory activity against the production of nitric oxide (NO) and molecular docking analysis on iNOS supported experimental data. Furthermore, GR24 dose dependently suppressed the LPS-induced iNOS expression at both mRNA and protein level. It also significantly decreased IL-1 beta release, mRNA expression of IL-1 beta and COX-2, as well as nuclear accumulation of NF kappa B at the low micro molar range in LPS-stimulated murine macrophages. GR24 promoted AKT activation in insulin resistant skeletal muscle cells and downregulated the expression of enzymes, PEPCK and G6Pase control the rate limiting steps of gluconeogenesis in hepatic cells. The results of molecular docking and ADMET analyses indicated that GR24 might be classified as druggable molecule in drug design. Taken together, all results suggest that SLs can be promising multi-potent botanical leads for the mitigation of inflammatory-mediated chronic disorders.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Looking at NSAIDs from a historical perspective and their current status in drug repurposing for cancer treatment and prevention
    (Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, 2023) Özleyen, Adem; Yılmaz, Yakup Berkay; Dönmez, Serhat; Atalay, Hazal Nazlıcan; Antika, Gizem; Boyuneğmez Tümer, Tuğba
    Non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) are one of the most frequently prescribed drug classes with wide therapeutic applications over the centuries. Starting from the use of salicylate-containing willow leaves to the recent rise and fall of highly selective cyclooxygenase-2 (COX-2) inhibitors and the latest dual-acting anti-inflammatory molecules, they have displayed a rapid and ongoing evolution. Despite the enormous advances in the last twenty years, investigators are still in search of the design and development of more potent and safer therapy against inflammatory conditions. This challenge has been increasingly attractive as the emergence of inflammation as a common seed and unifying mechanism for most chronic diseases. Indeed, this fact put the NSAIDs in the spotlight for repurposing against inflammation-related disorders. This review attempts to present a historical perspective on the evolution of NSAIDs, regarding their COX-dependent/independent mode of actions, structural and mechanism-based classifications, and adverse effects. Additionally, a systematic review of previous studies was carried out to show the current situation in drug repurposing, particularly in cancers associated with the GI tract such as gastric and colorectal carcinoma. In the case of non-GI-related cancers, preclinical studies elucidating the effects and modes of action were collected and summarized.
  • Küçük Resim
    Öğe
    New nimesulide derivatives with amide/sulfonamide moieties: Selective COX-2 inhibition and antitumor effects
    (Elsevier Masson s.r.l., 2021) Güngör, Tuğba; Özleyen, Adem; Yılmaz, Yakup Berkay; Siyah, Pınar; Ay, Mehmet; Boyuneğmez Tümer, Tuğba
    Seventeen new amide/sulfonamide containing nimesulide derivatives were synthesized and characterized by several spectroscopic techniques and primarily investigated for their inhibitory potential on COX enzymes and other pro-inflammatory factors. Experimental analyses showed that among seventeen compounds, N8 and N10 have remarkable potency and selectivity for the COX-2 enzyme over COX-1 at very low doses as compared to nimesulide. Moreover, both N8 and N10 selectively reduced the Lipopolysaccharide (LPS)-stimulated COX-2 mRNA expression level while the COX-1 level remained stable. Both PGE2 release and nitric oxide production in macrophage cells were significantly suppressed by the N8 and N10 treatment groups. In silico ADME/Tox, molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations were also conducted. Additionally, all compounds were also screened in a panel of cancer cell lines for their antiproliferative properties by MTT and SRB assays. Compound N17 exhibited a considerable antiproliferative effect on the colon (IC50: 9.24 μM) and breast (IC50: 11.35 μM) cancer cell lines. N17 exposure for 48 h decreased expression of anti-apoptotic protein BCL-2 and increased the expression of apoptogenic BAX. Besides, the BAX/BCL-2 ratio was increased with visible ultrastructural changes and apoptotic bodies under scanning electron microscopy. In order to investigate the structural and dynamical properties of selected hits on the target structures, multiscale molecular modeling studies are also conducted. Our combined in silico and in vitro results suggest that N8 and N10 could be further developed as potential nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), while cytotoxic N17 might be studied as a potential lead compound that could be developed as an anticancer agent.
  • [ X ]
    Öğe
    Yeni Nesil Anti-Inflamatuar Moleküllerin In-Siliko Tasarımı, Sentezi, Etkinlik Taraması Ve İkincil Antikarsinojenik Özellikleri Ile Mekanizmalarının Aydınlatılması
    (2022) Tümer, Tuğba; Güngör, Tuğba; Ay, Mehmet; Özleyen, Adem; Yılmaz, Yakup Berkay
    İnflamasyon, canlı organizmaların patojenler, hasarlı hücreler veya kötü yaşam koşulları gibi zararlı uyaranlara karşı gösterdiği doğal bir bağışıklık tepkisidir. Uzun süreli inflamasyon artrit, diyabet, astım gibi hastalıkların ortaya çıkması ile ilişkilidir. Bu nedenle, kronik inflamasyonun inhibisyonu çeşitli hastalıklar için alternatif bir terapötik ve önleyici strateji olabilir. Steroid olmayan antiinflamatuar ilaçlar (NSAİİler), çoğunlukla siklooksijenaz (COX) ve lipooksijenaz (LOX) yolakları üzerindeki etkileri nedeniyle inflamasyona karşı iyi bilinen ve yaygın olarak kullanılan ilaç sınıfıdır. Son birkaç yıldır, NSAİİler antikanser etkinlikleri ile de dikkat çekmiştir. Ancak, NSAİİlerin uzun süreli kullanımı, kardiyovasküler bozukluklar ve gastrointestinal hasar dahil olmak üzere birçok rahatsızlığa yol açmaktadır. Bu olumsuzluklardan dolayı etki gücü yüksek ve daha az yan etkiye sahip yeni nesil bileşiklerin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Bu çalışmamızda COX, 5-LOX, iNOS hedefleri ile etkileşen, birden fazla biyolojik molekülü aynı anda hedef alan etki gücü yüksek, aynı zamanda hücre koruyucu etkisi olan gaz salıcılar veya doğal ürün türevleri ile yan etkisi düşük yeni nesil anti-inflamatuar ilaç etken molekülleri belirlenmiş ve in siliko (parça temelli) tekniklerle tasarlanmıştır. Tasarlanan bileşikler yeni yaklaşımlar kullanılarak sentezlenmiş, saflaştırılmış ve yapıları aydınlatılmıştır. Tekrarlayan in siliko, sentez ve in vitro çalışmalar ile en etkin, çok hedefli antiinflamatuar ve antikanserojenik ilaç öncül adayları belirlenmiştir. Buna göre Nimesulid türevi bileşikler grubunda iki özgün bileşik (N8 ve N10) güçlü antiinflamatuar etkinlik gösterirken yine bu grupta yer alan özgün N17 bileşiği meme ve kolon kanseri hücre hatlarında iyi derecede antikanserojenik etki sergilemiştir. Tüm H2S salan bileşikler arasında, iki özgün bileşik (S6 ve S8) antikanserojenik özllikleri ile ön plana çıkmış, izotiyosiyanat türevi bileşiklerde ise I1den türeyen bileşiklerde yüksek antiinflamatuar aktivite ve antikanserojenik aktivite gözlemlenmiştir. Ayrıca, H2S salan bileşikler ile izotiyosiyanat türevlerinin tümü, 4 saatlik süreç boyunca tercih edilen salınım olan yavaş H2S salınımı göstermiştir. Bu sonuçlar bilinen ve hem nutrosötik hem de farmasötik özellikleriyle dikkat çeken sülforafan ve moringin gibi doğal izotiyosiyanatlar ile uyumlu ve hatta daha iyi sonuçlar göstermiştir. Özetle, özgün N8, N10, I1a, I1b, I1c, I1d ve I1e bileşiklerinin potansiyel antiinflamatuar ajanlar ve N17, S6, S8, I1 ve I2 bileşiklerinin ise kanser tedavisi ve önlenmesi için umut vadeden antikanser ajanları olarak daha ileri çalışmalar gerektirdiği sonucuna varılmıştır. Ekibimiz tarafından, bu bileşiklerin in siliko rehberli çalışmalar doğrultusunda türevlendirilmesi ve klinik öncesi in vivo çalışmalar gerçekleştirmek üzere ilaç şirketleri ile ortak, yeni, öncelikli alan ARGE projelerinin geliştirilmesi üzerine çalışmalarımız devam etmektedir.