Yazar "Sevinç, Ünal" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    Antepfıstığı türlerinde Alternaria yanıklık etmeni Alternaria spp.'nin popülasyon genetik analizleri
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2016) Sevinç, Ünal; Özkılınç, Hilal
    Alternaria alternata ve A. tenuissima, Alternaria cinsi içerisinde alternata-tür grubunda yer alan ve geniş bir konukçu aralığına sahip fungal patojenlerdir. Bu patojenler, Antepfıstığı ve yabani akrabalarını içeren Pistacia türlerinde "Alternaria yanıklık" hastalığına yol açmaktadır. Patojen popülasyonların genetik yapılarının bilinmesi, bitki hastalıklarıyla mücadele için oldukça önemlidir. Bu açıdan ülkemizde Antepfıstığı ve yabani akrabalarında Alternaria yanıklık etmeni Alternaria spp. patojenlerinin Güneydoğu Anadolu ve Ege/Marmara Bölgeleri'ndeki popülasyonlarının genetik çeşitliliklerinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu kapsamda 4 farklı konukçuya (Pistacia vera, P. terebinthus, P. lentiscus, P. atlantica) ait 50 izolat seçilmiş, OPA1.3 anonim DNA bölgesi ve protein kodlayan Alternaria major allergen a1 (Alt_a_1), endopolygalacturonase (EndoPG), histon-3 genlerine ait sekans verileri elde edilmiştir ve bu veriler üzerinden Neighbour-Joining ve Maksimum Parsimony ağaçları çıkarılmıştır. Yaygın klonal yapı ile beraber çeşitli dallanmalar görülmüş, ancak filogenetik açıdan kuvvetle ayrılan hatlar bulunmamıştır. Ayrıca aseksüel üreme yapısına rağmen MAT1 lokusunda farklı eşey tiplerini temsil eden Mat1.1 ve Mat1.2 genlerinin 1:1 oranındaki dağılımı da bu popülasyonlardaki genetik çeşitliliğe işaret eden diğer bir kanıt olmuştur. Mevcut genetik çeşitlilik ile coğrafik lokasyon veya konukçu gibi patojen orijin kaynakları arasında ilişki görülmemiştir. Ayrıca, EndoPG üzerinde TaqI restriksiyon kesim bölgelerine göre A. alternata/A. tenuissima ve Alternaria Yanıklık hastalığıyla ilgili diğer bir yakın tür olan A. arborescens'in ayrılabildiği tespit edilmiştir. Bu çalışma, TÜBİTAK-TOVAG 112O554 projesi desteği ile gerçekleştirilmiştir. Anahtar sözcükler: Alternaria, Genetik varyasyon, Sekans analizi, Eşey tipi
  • [ X ]
    Öğe
    Türkiye’de Antepfıstığı (Pistacia vera) ve diğer Pistacia Türlerinde Alternaria Yanıklık Hastalığına Neden Olan Alternaria spp.’nin Moleküler ve Patojenik Karakterizasyonları ve Hastalık Epidemiyolojisinin Araştırılması
    (2016) Özkılınç, Hilal; Kar, Yağmur; Can, Canan; Sevinç, Ünal; Polatbilek, Hatice; Sarpkaya, Kamil; Konukoğlu, Fatma
    Alternaria yanıklığı bu önemli ürün bitkisi için ciddi fungal hastalıklardan biridir. Türkiye’de gözlenen hastalık semptomları çoğunlukla meyve kısmında kahverengileşme/kararma lezyonlardır ve bu durum ürün kalitesinde azalmaya yol açmaktadır. Hastalık epidemileri Türkiye’de son yıllarda görülmektedir. Türkiye’deki yabani Antepfıstığı türlerinin (Pistacia spp.) de Alternaria yanıklığı’ndan etkilendiği fark edilmiştir. Proje kapsamında hastalık etmenlerini karakterize etmek üzere, Güneydoğu Anadolu, Akdeniz, Ege ve Marmara Bölgeleri’nde Antepfıstığı ve yabani akrabalarından örneklemeler yapılmıştır. İzolatlar morfolojik ve moleküler açıdan değerlendirilmiştir ve yaygın olarak hastalık etmeninin A. alternata olduğu belirlenmiştir. Genomik DNA üzerindeki beş bölge (Alt_a1, ATPase, Endo_PG, OPA1.3 ve SCAR2) için alınan sekans verileri kullanılarak yapılan filogenetik analizlerde, A. alternata ve A. tenuissima tek bir filogenetik tür olarak temsil edilirken, A. arborescens farklı bir filogenetik tür olarak ayrılmıştır. Hem morfolojik hem moleküler verilere göre net bir şekilde sadece bir adet A. arborescens izolatı belirlenirken, morfolojik kriterlere göre A. alternata/A. arborescens arasında ara tip özellikleri sergileyen, filogenetik analizlere göre ise A. arborescens’e daha yakın olan üç adet izolat bulunmuştur. Yaygın klonal yapı ile birlikte patojenik çeşitliliğin varlığı hem çalışılan farklı DNA bölgeleri hem de Mat1.1 ve Mat1.2 eşey tiplerinin 1:1 oranındaki dağılımı ile gösterilmiştir. İn vitro patojenisite denemelerinde izolatların izole edildiği konukçu, bölge veya doku (meyve veya yaprak) özelleşmesi göstermeksizin Antepfıstığı meyvelerinde patojenik oldukları belirlenmiştir. Spor uçuşlarının ilkbaharda başlayıp, yaz aylarında arttığı ve sonbaharda azaldığı pilot lokasyonlarda tespit edilmiştir. Enfeksiyonlar için en uygun sıcaklık aralığının 20-27°C olduğu belirlenmiştir. Bazı fungisitlerin in vitro’da testlenen izolatlar üzerinde etkileri farklılık göstermiştir. Detaylı ve geniş kapsamlı olarak ilk defa ülkemizdeki yabani ve kültür Antepfıstığı’nda Alternaria yanıklık hastalığı etmenlerini karakterize eden bu bulguların, hastalık kontrol stratejilerinin geliştirilmesine yardımcı olacağı umulmaktadır.