Yazar "Sarpkaya, Kamil" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    Pathogenicity, Morpho-Species and Mating Types of Alternaria spp. causing Alternaria blight in Pistacia spp. in Turkey
    (Springer, 2017) Ozkilinc, Hilal; Sarpkaya, Kamil; Kurt, Sener; Can, Canan; Polatbilek, Hatice; Yasar, Aysegul; Sevinc, Unal
    Alternaria genus includes many plant pathogens on numerous hosts, causing leaf spots, rots and blights. Alternaria blight has been observed as one of the important fungal diseases of pistachio (Pistacia vera L.) as well as its wild relatives (P. terebinthus, P. lentiscus, P. khinjuk, P. atlantica, P. mutica) in Turkey. Alternaria species were sampled from Pistacia spp. hosts from different geographic regions in Turkey during field trips in late spring to early fall of 2013. Alternaria blight symptoms were observed mainly on fruits and rarely on leaves. Four hundred and twenty two of the isolates were morphologically defined as A. alternata, A. tenuissima, A. arborescens and also intermediate morpho-species between A. alternata/A. arborescens. Pathogenicity of the isolates was confirmed with host inoculations on detached fruits. Mating types of 270 isolates of Alternaria spp. from the collection were identified using a PCR-based mating type assay that amplifies either a MAT1-1 or a MAT1-2 fragment from the mating locus. Although a strongly clonal population structure was expected due to the putative asexual reproduction of these fungi, both idiomorphs were detected at equal frequencies at several different spatial scales. The distribution of mating types within each geographic region, within host species as well as in overall collection was not significantly different from 1:1. Amplified fragments of partial idiomorph sequences were obtained for representative isolates. Parsimony trees were depicted based on sequence data of mating type genes for these representative isolates as well as some other Alternaria species obtained by Genebank. Several point mutations presented a few clusters which are supported by high bootsrapped values. The Alternaria blight disease agents both from cultivated and wild hosts were pathogenic on pistachio which may cause difficulties to control the disease because of extensity of pathogen sources. Besides, equal mating type distribution of the pathogen at both geographic and host species levels suggests a potential for sexual reproduction of Alternaria spp. in Turkey.
  • [ X ]
    Öğe
    Türkiye’de Antepfıstığı (Pistacia vera) ve diğer Pistacia Türlerinde Alternaria Yanıklık Hastalığına Neden Olan Alternaria spp.’nin Moleküler ve Patojenik Karakterizasyonları ve Hastalık Epidemiyolojisinin Araştırılması
    (2016) Özkılınç, Hilal; Kar, Yağmur; Can, Canan; Sevinç, Ünal; Polatbilek, Hatice; Sarpkaya, Kamil; Konukoğlu, Fatma
    Alternaria yanıklığı bu önemli ürün bitkisi için ciddi fungal hastalıklardan biridir. Türkiye’de gözlenen hastalık semptomları çoğunlukla meyve kısmında kahverengileşme/kararma lezyonlardır ve bu durum ürün kalitesinde azalmaya yol açmaktadır. Hastalık epidemileri Türkiye’de son yıllarda görülmektedir. Türkiye’deki yabani Antepfıstığı türlerinin (Pistacia spp.) de Alternaria yanıklığı’ndan etkilendiği fark edilmiştir. Proje kapsamında hastalık etmenlerini karakterize etmek üzere, Güneydoğu Anadolu, Akdeniz, Ege ve Marmara Bölgeleri’nde Antepfıstığı ve yabani akrabalarından örneklemeler yapılmıştır. İzolatlar morfolojik ve moleküler açıdan değerlendirilmiştir ve yaygın olarak hastalık etmeninin A. alternata olduğu belirlenmiştir. Genomik DNA üzerindeki beş bölge (Alt_a1, ATPase, Endo_PG, OPA1.3 ve SCAR2) için alınan sekans verileri kullanılarak yapılan filogenetik analizlerde, A. alternata ve A. tenuissima tek bir filogenetik tür olarak temsil edilirken, A. arborescens farklı bir filogenetik tür olarak ayrılmıştır. Hem morfolojik hem moleküler verilere göre net bir şekilde sadece bir adet A. arborescens izolatı belirlenirken, morfolojik kriterlere göre A. alternata/A. arborescens arasında ara tip özellikleri sergileyen, filogenetik analizlere göre ise A. arborescens’e daha yakın olan üç adet izolat bulunmuştur. Yaygın klonal yapı ile birlikte patojenik çeşitliliğin varlığı hem çalışılan farklı DNA bölgeleri hem de Mat1.1 ve Mat1.2 eşey tiplerinin 1:1 oranındaki dağılımı ile gösterilmiştir. İn vitro patojenisite denemelerinde izolatların izole edildiği konukçu, bölge veya doku (meyve veya yaprak) özelleşmesi göstermeksizin Antepfıstığı meyvelerinde patojenik oldukları belirlenmiştir. Spor uçuşlarının ilkbaharda başlayıp, yaz aylarında arttığı ve sonbaharda azaldığı pilot lokasyonlarda tespit edilmiştir. Enfeksiyonlar için en uygun sıcaklık aralığının 20-27°C olduğu belirlenmiştir. Bazı fungisitlerin in vitro’da testlenen izolatlar üzerinde etkileri farklılık göstermiştir. Detaylı ve geniş kapsamlı olarak ilk defa ülkemizdeki yabani ve kültür Antepfıstığı’nda Alternaria yanıklık hastalığı etmenlerini karakterize eden bu bulguların, hastalık kontrol stratejilerinin geliştirilmesine yardımcı olacağı umulmaktadır.