Yazar "Kozma, Zerrin" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    Characterization of Cryphonectria parasitica From Native Chestnut Trees in Kaz Mountain (Mount Ida)
    (2018) Özkılınç, Hilal; Kozma, Zerrin; Pekdemir, Burcu; Gülnar, Birgul
    Cryphonectria parasitica is a causal agent of chestnut blight worldwide and it dramatically affectsnatural chestnut trees in Kaz Mountain (Mount Ida). Different biological control approaches have been proposed toconstrain the disease. The pathogen has mating system with two alternate idiomorphs which may increasepathogen genetic variability due the recombination events. In this study, C. parasitica isolates were diagnosed withpartial sequencing of Translation Elongation Factor-1? (Ef-1?) gene, tested for their pathogenicity, evaluated fortheir mating types, and the isolates of Trichoderma sp. which were isolated from the same lesion where someisolates of C. parasitica were obtained were investigated for antagonistic effect on C. parasitica. It was notdetected any mutation in sequenced part of Ef-1? gene. All the isolates were confirmed as pathogen in in vitroassays by inoculation to apple fruit. Only one mating type (Mat1-1) was detected for some of the isolates.Trichoderma sp. isolates were suppressed in vitro growth rate of C. parasitica. Both C. parasitica andTrichoderma sp. caused necrotic symptoms on the fruits once they were inoculated on apple, but, Trichoderma sp.did not affect lesion development caused by C. parasitica. Overall results present that wild chestnut trees in KazMountain are under threat of chestnut blight pathogens having similar aggressiveness and genetic identity and,isolates of Trichoderma sp. obtained in this study should be assessed by in vivo experiments for their biocontrolability against to C. parasitica.
  • [ X ]
    Öğe
    Molecular characterization of Monilinia species associated with brown rot of stone fruits
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2018) Kozma, Zerrin; Özkılınç, Hilal
    Monilinia sert çekirdekli meyveler olarak bilinen şeftali, kiraz, erik gibi meyvelerde ve de elma, armut gibi bazı yumuşak çekirdekli meyvelerde kahverengi çürüklük veya monilya hastalığı olarak adlandırılan hastalığa neden olan fitopatojen fungal türleri içeren bir cinstir. Dünya'da bu hastalığın etmenleri olarak Monilinia cinsi içerisinde yer alan M. fructicola, M. fructigena ve M. laxa türleri yaygın olarak bildirilmiştir. Çanakkale yöresi başta şeftali olmak üzere çeşitli sert çekirdekli meyve üretiminde önemli bir yere sahiptir. Bu alanlarda monilya hastalığının özellikle çevre şartlarının hastalığı tetiklediği dönemlerde önemli bir problem olarak ortaya çıktığı ve özellikle şeftali meyvelerini etkilediği görülmüştür. Tez çalışması kapsamında Çanakkale yöresindeki şeftali ve kiraz gibi farklı konukçulardan elde edilebilecek monilya hastalığının patojen etmeni/etmenlerinin moleküler olarak tanımlanması ve genetik çeşitliliğin çeşitli moleküler markırlar ile çalışılması planlanmıştır. Çalışma kapsamında, yetmiş izolat değerlendirilmiştir ve tür-spesifik moleküler markırlar ile bu izolatların hepsi M. fructicola olarak tanımlanmıştır. İzolatlar arasında genetik varyasyonlar Internal Transcribed Spacer (ITS), Glyceraldehyde-3 phosphate dehydrogenase (G3PD), Chitin Synthase (CHS), Beta-tubulin (?-tubulin) ve Elongation factor-1? (Ef-1?) bölgelerine ait sekans verileri üzerinden değerlendirilmiştir. Mevcut izolat koleksiyonu içerisinde herhangi bir polimorfizm bulunanmamıştır. Elde edilen tek genotip, NCBI gen bankasında kayıtlı kahverengi çürüklük etmeni Monilinia türlerine ait çeşitli izolatlarla ITS, G3PD, ?-tubulin ve Ef-1? dizileri açısından kıyaslanmış ve Neighbour-Joining ağaçları çıkarılmıştır. Bu ağaçlar, bu çalışmada elde ettiğimiz genotipin, Çin ve Brezilya'daki bazı M. fructicola genotipleri ile yakın ilişkili olduğunu göstermiştir. Monilinia spp. için CHS gen bölgesi ilk defa bu tez kapsamında çalışıldığı için ayrıca kıyaslama yapılamamıştır. Patojen etmen/etmenlerin doğru tanımlanması ve popülasyon genetik yapılarının bilinmesi, bitki hastalıklarıyla mücadele için oldukça önemlidir.