Yazar "Karakaş, İlke" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • [ X ]
    Öğe
    Bazı potansiyel patojen mikroorganizmalara karşı eisenia fetida sölom sıvısının antimikrobiyal aktivitesinin araştırılması
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2019) Karakaş, İlke; Yapıcı, Binnur Meriçli
    Bu çalışmada, insanlarda hastalığa neden olan dokuz farklı klinik bakteriye karşı Eisenia fetida sölom sıvısının antibakteriyel aktivitesi araştırılmıştır. Bakteriyel izolatlar öncelikle morfolojik ve kültürel özellikleri dikkate alınarak gruplandırılmış ve sonrasında 16S rRNA dizi analizi ile tanılanmıştır. Dizi analizi sonuçlarına göre izolatlar Lactococcus lactis, Staphylococcus aureus, Bacillus nealsonii, Escherichia fergusonii, Shigella boydii, Salmonella enterica, Escherichia coli suşları olarak tanılanmıştır. Araştırmada klinik bakterilere karşı antibakteriyel madde olarak, saf sölom sıvısı ve sölom sıvısının %25, %50 ve %75'lik konsantrasyonlarda etil alkol, serum fizyolojik, dimetil sülfoksit ve kloroform ile homojenize edilmesiyle elde edilen çözeltiler kullanılmıştır. Antibakteriyel maddelerin bakteri kültürlerine karşı antibakteriyel aktivitesi disk difüzyon ve mikrodilüsyon yöntemleri ile belirlenmiştir. Ayrıca saf sölom sıvısının bakteriyel izolatlar üzerindeki etkinliğini gözlemlemek amacıyla taramalı elektron mikroskobu ve transmisyon elektron mikroskobu ile inceleme yapılmıştır. Disk difüzyon sonuçlarına göre saf sölom sıvısından elde edilen en yüksek inhibisyon zon çapı değerleri Escherichia coli (İ-1), Escherichia coli (B-1) ve Shigella boydii klinik suşları için sırasıyla 35,50 mm, 33,75 mm ve 24,50 mm olarak tespit edilmiştir. Ayrıca denemelerde kullanılan çözücü miktarındaki artışa bağlı olarak inhibisyon zon çaplarında azalma meydana geldiği belirlenmiştir. Araştırmanın Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu (MİK) bulgularına göre saf sölom sıvısının MİK aralığı %0,03 (v/v) ile %4 (v/v) ve diğer antibakteriyel çözeltilerden elde edilen MİK aralığı ise %0,03 (v/v) ile %8 (v/v) olarak tespit edilmiştir. Taramalı alan mikroskobu ile yapılan incelemelerde saf sölom sıvısının S. aureus ve E. coli suşlarının biyofilm oluşturma kapasitesilerinde bir azalmaya neden olduğu gözlemlenmiştir. Transmisyon elektron mikroskobu ile yapılan incelemelerde ise saf sölom sıvısının yine aynı bakteri hücreleri üzerinde hücre duvarı ve membranında hasar oluşturduğu ve bazı hücrelerin tamamen lizize olduğu tespit edilmiştir. Çalışmada denenen birçok antibiyotiğe dirençli bulunan bakteri suşlarına karşı gerek sölom sıvısı ve gerekse ondan elde edilen çözeltilerin antibakteriyel etkinlik sergilemesi nedeniyle; sölom sıvısı ile ilgili daha ileri araştırmaların yürütülmesi gerektiği kanaatine varılmıştır.
  • [ X ]
    Öğe
    Nikelce Zengin Topraklardan (Çanakkale) İzole Edilen Bakterilerin Bitki Büyüme Teşvik Edici Potansiyellerinin Belirlenmesi
    (2022) Karakaş, İlke; Ay, Mustafa; Öztürk, Furkan; Kaya, Selen; Doğru, Nurcihan Hacıoğlu
    Bitki büyümesini teşvikleyici rizobakteriler (PGPR), bitkinin hastalıklara dirençli hale gelmesinde önemli rol oynamaları sebebiyle sürdürülebilir tarım sistemlerine katkı sağlamaktadır. Bu çalışmada, Çanakkale ili Ezine ilçesinin 6 km kuzeyinde bulunan serpantin yamaçlarında yayılan Alyssum pinifolium (Nyar, T.R. Dudley) bitki köklerinden alınan toprak örneklerinden elde edilen bakteri izolatlarının bitki büyüme teşvik edici potansiyelleri araştırılmıştır. Elde edilen 21 izolatın 16S rDNA analizi ile yapılan identifikasyonlarında Bacillus, Priestia ve Brachybacterium cinslerine ait olduğu saptanmıştır. 21 izolatın PGPR olma potansiyellerini ortaya koymak için in vitro şartlarda azot fikse etme, fosfor çözme yetenekleri, indol-3-asetik asit (IAA), ve siderofor üretme kapasiteleri belirlenmiştir. Çalışmada kullanılan tüm izolatların fosfor çözme yeteneği olduğu saptanmıştır. İzolatların fosfor çözme oranları 2.047 µg/mL ile 2.600 µg/mL arasında bulunmuş olup en yüksek değer Bacillus toyonensis NMCC-157’ten elde edilmiştir. 21 izolat için azot fiksasyon özelliği tespit edilememiştir. IAA üretim yeteneği 51.4 µg/mL ile 278.5 µg/mL arasında ölçülmüş ve en yüksek IAA üretimi Brachybacterium nesterenkovii NY-3 tarafından gerçekleştirilmiştir. İzolatların %47.6’sının siderofor üretim yeteneği olduğu belirlenirken en yüksek siderofor üretimi B. toyonensis NMCC-157’ten elde edilmiştir. Araştırma sonuçları, yüksek miktarlarda siderofor, IAA üretimi ve fosfor çözme gibi bitki büyümesini teşvik edici markör özelliklere sahip olan Bacillus cinslerinin ekonomik açıdan değerli kültür bitkilerinin yetiştirilmesinde biyogübre olarak kullanılma potansiyeline sahip olduğunu göstermiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    Pigment Production From Bacteria Isolated From Whey
    (2024) Çardak, Sude; Karakaş, İlke; Doğru, Nurcihan Hacıoğlu
    Environmental pollution and population growth necessitate more efficient production processes. Organic whey, which is a low-cost substrate for the food industry, constitutes a promising raw material with its low cost and chemical content for biotechnological processes. This study investigated the pigment production capabilities of bacteria isolated from whey, an industrial waste. Among the isolated bacteria, 4 were determined to be effective pigment producing bacteria. The pigment was extracted from 4 isolates. Pigment characterization was performed by UV spectrophotometer (OD470-OD580) and Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR). As a result of the spectrum scanning, it was determined that all pigments gave the maximum absorbance value in the range of 500 nm to 505 nm. In FTIR analysis, all extracted pigments showed characteristic absorption bands of carotenoids between 400 nm and 520 nm. The FTIR peaks obtained from 1469 cm-1 and 1726 cm-1 regions are known as the fingerprint regions of microbial pigments for biorecolorants. When the results obtained in our study are compared with the literature data, the absorbance values obtained show that the pigment produced is carotenoid and its derivative.