Yazar "Kablan, Ahmet" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • [ X ]
    Öğe
    Expanding the Genetic and Phenotypic Spectrum of Mowat-Wilson Syndrome: A Study of 10 Turkish Patients With an Intrafamilial Recurrence Caused by First Intragenic Large Deletion
    (Wiley, 2024) Kablan, Ahmet; Aru, Esma Erturkmen; Atar, Suleyman; Gumus, Aydeniz Aydin; Ili, Ezgi Gokpinar; Kayhan, Gulsum; Tekin, Koray
    Mowat-Wilson syndrome (MWS) is a complex disorder caused by heterozygous ZEB2 gene variations creating haploinsufficiency. The main clinical features are evolving facial dysmorphism, intellectual disability, eye and brain malformations, and various organ anomalies. Our study examines 10 Turkish patients, who had clinical diagnosis, underwent evaluation, clinical investigations, and genetic tests in multiple tertiary centers across T & uuml;rkiye, and were molecularly diagnosed with MWS. Molecular analysis with sequencing techniques alongside array testing unveiled disease-causing variations in addition to novel variants, including two siblings with recurrent multiexon deletion. Clinical presentations varied, featuring neurodevelopmental delay and characteristic facial traits and organ malformations across all cases, alongside less frequently reported manifestations such as laryngomalacia or rocker bottom feet in addition to new features such as macroorchidism and osteoporosis. Our findings expand the genetic and phenotypical spectrum of MWS, and hint at potential implications of gonadal mosaicism. While establishing clear genotype-phenotype correlations poses challenges, comprehensive genetic testing remains pivotal for precise diagnosis and management. The study highlights the complexity of MWS genetics, with potential implications of gonadal mosaicism on recurrence. Further research is needed to elucidate mechanisms driving phenotypic variability, potential hotspots, and mechanisms for recurrent variations. We report on the largest cohort with MWS from T & uuml;rkiye.
  • [ X ]
    Öğe
    Parkinson genetik etiyogenezinde yeni nesil dizileme (NGS) yöntemi ile saptanan varyantların in-siliko analizi
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2021) Kablan, Ahmet; Özdemir, Öztürk
    GİRİŞ ve AMAÇ: Parkinson hastalığı sıklıkla ileri yaş popülasyonda görülen substansiya nigra bölgesindeki dopaminerjik nöronların kaybı ile karakterize bir hareket bozukluğu hastalığıdır. Hastalığın %5-15'i genetik yatkınlıkla ilişkilendirilmiştir. Bu çalışmada, moleküler etiyolojik sebeplerin önemli ölçüde heterojenlik gösterdiği parkinsonizmde, Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi Tıbbi Genetik Tanı ve Tedavi laboratuvarında yeni nesil DNA dizileme yöntemi ile (NGS) elde edilen çoklu test ve klinik verilerin retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. GEREÇ ve YÖNTEM: Bu araştırmada elde edilen veriler, 2018-2019 yılları içerisinde merkezimize başvuran toplam 43 olguya ait aile öyküleri, klinik bilgileri yanısıra güncel literatür tarafından Parkinson hastalığı ile ilişkilendirilmiş toplam 18 gen içeren gen paneli kullanılarak elde edilen laboratuvar verileri retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Parkinson hastalığı genetik etiyolojisi açısından erişilebilir güncel literatür değerlendirildiğinde ülkemizde yapılan en geniş gen panelinin kullanıldığı genetik etiyoloji çalışmasıdır. Araştırmada, çalışmaya dahil edilen olgulara ait; anamnezler gözden geçirildi, genetik verileri ve aile ağaçları elde edildi, değerlendirildi. Elde edilen genetik varyantlar doğrultusunda olgulara ait fenotip – genotip ilişkisi güncel literatür ile korele edildi. BULGULAR: Güncel veritabanları değerlendirmesine tabi tutulan verilerin analizi sonucunda her olguda en az bir olmak üzere toplam 14 vakada klinikle uyumlu olabilecek genetik varyant saptandı. Değerlendirilen 29 olguda klinik olarak anlamlı olabilecek genetik varyant saptanmadı. Parkinson patogenezinde primer olarak bildirilen toplam 3 spesifik varyant tanımlanmıştır. Saptanan bu spesifik varyantların (EIF4G1 c.3142A>G (p.Ser1048Gly), ATP13A2 c.2859G>A (p.Thr953=), LRRK2 c.4915delA(p.Arg1639GlyfsTer15)) Parkinsonizm genetik etiyogenezinde önemli ölçüde uyumluluk gösterdikleri değerlendirilmiştir. Olgularımıza ait daha önce bildirilmemiş iki yeni varyant saptanmıştır. TARTIŞMA ve SONUÇ: Araştırma sonunda NGS analizlerinde kullanılan veri tabanlarının güncellenmesi ve konu ile ilgili yeni üretilmiş akademik verilerle desteklenmesinin Parkinson hastalarının doğru ve etkin tanı almalarında önemli ölçüde katkı verici olduğu anlaşılmıştır. Bu duruma örnek olarak, aynı genetik verilerin farklı zamanlarda revize edilmiş veri tabanları ile değerlendirildiklerinde farklı klinik önemde değerlendirildiği açıklıkla görülecektir. Sonuç olarak, moleküler etiyolojik tetikleyicilerin önemli ölçüde heterojenlik gösterdiği Parkinsonizmde doğru ve etkin tanı için NGS yönteminin sağladığı faydanın yanı sıra, elde edilen verilerin Tıbbi Genetik alanında tanı amaçlı kullanılan ileri test ve yöntemlerle korele edilmesi ve seçilmiş olgularda hasta ve varyantların takibi ve belirli aralıklarla tekrardan değerlendirilmesi, bu doğrultuda genetik danışma planlanmasının yararlı olacağı önerilmiştir. Olguların, daha geniş kohortların dahil edildiği, kapsamlı paneller ile çalışılmasının ve bu çalışılan panellerin yine sürekli güncellenen veri tabanları ile değerlendirilmesinin hayati öneme sahip olduğu anlaşılmıştır.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Re-evaluation of Genetic Variants in Parkinson's Disease Using Targeted Panel and Next-Generation Sequencing
    (Cambridge University Press, 2023) Kablan, Ahmet; Sılan, Fatma; Özdemir, Öztürk
    Parkinson's disease (PD) is a complex disorder with a significant genetic component. Genetic variations associated with PD play a crucial role in the disease's inheritance and prognosis. Currently, 31 genes have been linked to PD in the OMIM database, and the number of genes and genetic variations identified is steadily increasing. To establish a robust correlation between phenotype and genotype, it is essential to compare research findings with existing literature. In this study, we aimed to identify genetic variants associated with PD using a targeted gene panel with next-generation sequencing (NGS) technology. Our objective was also to explore the idea of re-analyzing genetic variants of unknown significance (VUS). We screened 18 genes known to be related to PD using NGS in 43 patients who visited our outpatient clinic between 2018-2019. After 12-24 months, we re-evaluated the detected variants. We found 14 different heterozygous variants classified as pathogenic, likely pathogenic, or VUS in 14 individuals from nonconsanguineous families. We re-evaluated 15 variants and found changes in their interpretation. Targeted gene panel analysis with NGS can help identify genetic variants associated with PD with confidence. Re-analyzing certain variants at specific time intervals can be especially beneficial in selected situations. Our study aims to expand the clinical and genetic understanding of PD and emphasizes the importance of re-analysis.