Yazar "Doğan, Gamze" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • [ X ]
    Öğe
    Saccharomyces cerevisiae maya türünde NRG1 proteininin NTH1 gen ekspresyonuna etkisinin belirlenmesi
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2017) Doğan, Gamze; Genç, Tülay Turgut
    İndirgenmemiş disakkarit olan trehaloz, Saccharomyces cerevisiae maya hücreleri tarafından enerji yedeği olarak normal koşullarda biriktirilir. Ayrıca farklı çevresel streslere karşı hücre içi trehaloz miktarının strese yanıt olarak artış gösterdiği bilinmektedir. Aynı zamanda, trehaloz, sinyal molekülü ve stres metaboliti olarak işlev görür. Stres koşulları sona erdiğinde ise biriktirilen trehalozun hızlı bir şekilde glukoza yıkımı gerçekleşir. Trehaloz şekerinin sentezi TPS enzim kompleksi ile gerçekleşirken, yıkımı ise nötral trehalaz enzimi tarafından gerçekleşir ve hücre içerisindeki miktarı belli bir seviyede tutulur. Bu nedenle trehaloz metabolizmasıyla ilgili genlerin iyi bir şekilde kontrol edilmesi gerekir. Farklı stres koşullarında NTH1 geninin transkripsiyonun aktive olduğu ve bu aktivasyonun gerçekleşmesi içinde NTH1 geninin promotor bölgesinde bulunan Stress Response Element (STRE) olarak adlandırılan nükleotid dizilerinin gerekli olduğu bilinmektedir. Transkripyonel represör aktivitesi olan Nrg1 proteini farklı streslere karşı oluşturulan cevaplarda ve karbon stresinde görev alan genlerin regülasyonunda görev almaktadır. Nrg1 proteininin STRE ve PDS elementlerine bağlanabildiği bilinmektedir. NTH1 geninin promotor bölgesinde 3 adet olası Nrg1p bağlanma bölgesi bulunmaktadır. Bu nedenle bu tez araştırmasında Nrg1 transkripsiyon faktörünün NTH1 gen ekspresyonunun regülasyonundaki rolü incelendi. Yapılan biyoinformatik çalışmalarla Nrg1 proteininin NTH1 promotorunda bulunan STRE elementlerine yaklaştığı gözlemlendi. Çalışmada SUC2-LacZ ve NTH1-LacZ gen füzyonu içeren plazmidler, çoğaltılıp saflaştırıldıktan sonra yaban tip ve ?nrg1 mutasyonu bulunduran S. cerevisiae maya suşlarına transfer edildi. Azot stresi koşullarında NTH1 gen ekspresyonunun arttığı bilinmektedir. Bu nedenle farklı azot kaynaklarında üretilen transformant S. cerevisiae maya hücrelerinden örnekler alınarak, NTH1 gen aktivasyonu ve biriktirilen trehaloz miktarı enzimatik yöntemle belirlendi. Araştırmada Nrg1 proteinin normal şartlarda NTH1 transkripsiyonunun baskılanması için gerekli olduğu bulundu.