Yazar "Demirbaş, Sefer" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • [ X ]
    Öğe
    Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. bitkisinde Phelipanche ramosa (L.) pomel parazitinin ve tuz stresinin neden olduğu fizyolojik, biyokimyasal ve gen ifadesi düzeyindeki değişimlerin araştırılması
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2011) Demirbaş, Sefer; Acar, Okan
    Canavar otu (Orobanche ve Phelipanche spp.) fotosentez yeteneğini kaybetmiş, su, organik karbon ve azot için tamamen konukçusuna ihtiyaç duyan tam kök paraziti bir bitkidir. Canavar otu bitkileri içinde yer alan Phelipanche ramosa (L.) Pomel, domates, patlıcan, patates, tütün, kenevir, kanola, mercimek, kavun gibi bitkilerde verim kayıplarına neden olmaktadır. Önemli bir abiyotik stres olan tuzluluk ise, Dünya karasal alanlarının yaklaşık % 20' sini, sulu tarım yapılan alanların ise yaklaşık olarak % 50' sini etkilemektedir.Bu çalışmada, Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. bitkisinde P. ramosa ve tuz stresinin toplam klorofil, klorofil a, klorofil b ve karotenoid pigmentlerinin içeriğine, lipit peroksidasyonu miktarına, SOD, POX, CAT, APX ve GR enzimlerinin aktivitesine ve COR78, COR6.6, RD29B, PR1, PDF1.2, GOLS3 ve GST1 genlerinin bağıl gen ifade düzeylerindeki değişime olan etkileri araştırılmıştır.Arabidopsis bitkisinde NaCl, enfeksiyon ve enfeksiyona NaCl etkisinin incelendiği tüm gruplarda antioksidatif savunma sistemi enzimlerinden SOD, POX, CAT ve GR aktivitelerinin zamana bağlı olarak arttığı, bitkilerin pigment içeriğinin ise zamana bağlı olarak azaldığı saptanmıştır.RD29B hariç COR78, COR6.6 ve GOLS3 genlerinin kontrol bitkilerine kıyasla her üç grupta zamana bağlı olarak artarak uyarılması, ozmoprotektanların sentezlenmeye başladığını ve böylece su kaybının önlenmeye çalışıldığına işaret etmektedir. Arabidopsis bitkilerinde PDF1.2 geninin ifadesinde meydana gelen artış etilen ve JA yolağına bağlı savunma sisteminin uyarılmış olduğunu, PR1 geninin baskılanmış olmasının SA' e bağlı savunma sistemini baskılamış olabileceğini, GST1 genin uyarılması ise oksidatif stresin meydana geldiğini işaret etmektedir.
  • [ X ]
    Öğe
    Bazı ayçiçeği (Helianthus annuus L.) varyetelerinde orobanche cumana Wallr. nın süperoksit dismütaz (SOD;E.C.1.15.1.1) ve peroksidaz (POD;E.C.1.11.1.7) aktiviteleri üzerine etkilerinin araştırılması
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2006) Demirbaş, Sefer; Acar, Okan
    BAZI AYÇİÇEĞİ (Helianthus annuus L.) VARYETELERİNDE Orobanchecumana Wallr.' NIN SÜPEROKSİT DİSMÜTAZ (SOD;E.C.1.15.1.1) VEPEROKSİDAZ (POD;E.C.1.11.1.7) AKTİVİTELERİ ÜZERİNEETKİLERİNİN ARAŞTIRILMASIÖZETAyçiçeği (Helianthus annuus L.) köklerini enfekte eden Orobanche cumanaWallr., tam parazit bir Angiosperm'dir. Ana vatanı Akdeniz bölgesidir. O. cumanaWallr. tohumları Trakya Bölgesinden (Tekirdağ-Hayrabolu) toplanmıştır.Araştırmada, Orobanche genusuna dayanıklılığı bilinen ayçiçeği varyeteleriPIONEER 4223 ve ilaçla dayanıklı SANAY ile Orobanche genusuna duyarlılığıbilinen ayçiçeği varyetesi olan ISERA kullanılmışıtır.O. cumana Wallr. bitkisi tohumları petri kaplarında bir hafta süresince nemlive karanlık bir ortamda bekletilmiştir ve 1 hafta sonra GR 24 uygulamasıyapılmıştır. Uygulamanın ardından çimlenen tohumlar araştırmada kullanılacakayçiçeği varyetelerinin köklerine penetre edilerek su kültüründe ayçiçeği fideleriylebirlikte yetiştirilmiştir. Penetrasyondan sonra her bir varyete için ayrı ayrı 1., 3., 5.,7. ve 9. günde uygulama yapılan ve kontrol grubu olarak tespit edilen ayçiçeğiköklerinden örnekleme yapılmıştır. Orobanche genusuna dayanıklılıkta, bitki -parazit ilişkisinden ileri gelen oksidatif stresin izlenmesi için antioksidatif savunmaenzimlerinden Süperoksit dismütaz (SOD;E.C.1.15.1.1) ve Peroksidaz(POD;E.C.1.11.1.7) aktivitelerindeki değişiklikler saptanmıştır.O. cumana Wallr. parazitine duyarlı olduğu bilinen ISERA, toplam SODmiktarları dikkate alındığında kısa süreli antioksidatif yanıt oluşturmakla birlikte, buyanıtlarını POD ile destekleyememektedir. O. cumana Wallr. parazitine toleranslıolduğu bilinen PIONEER 4223 varyetesinin hem toplam SOD miktarında hem dePOD aktivitesinde sergilediği anlamlı antioksidatif yanıtlar ise, bu yolun toleransmekanizmasında işlevsel olabileceğini göstermektedir. Bu anlamda, duyarlı ISERAivvaryetesinin toplam SOD miktarlarıyla POD aktiviteleri arasındaki uyumsuzlukonun duyarlılık mekanizmasını açıklayabilir. İlaçla dayanıklı olduğu bilinenSANAY varyetesi, araştırmamızda ilaç kullanılmadan incelenmiştir. Bu varyetedesaptanan SOD verileri anlamsız değişimler sergilemektedir. Aynı varyetenin PODaktiviteleri ise ISERA varyetesine zıt şekilde genellikle kontrole kıyasla yüksektir.Ancak her iki antioksidatif enzim için kontrole kıyasla anlamlı artışlarsaptanmamıştır. Bu durum SANAY varyetesinin ISERA varyetesine benzer şekildeO. cumana Wallr. parazitine duyarlı olduğuna işaret etmektedir.Araştırmamızda ayçiçeği-orobanş arasındaki ilişkide ortaya çıkan oksidatifstrese, PIONEER 4223 varyetesinin özellikle kısa süre için çok iyi yanıt oluşturduğusaptanmıştır.Anahtar Sözcükler: Ayçiçeği, Helianthus annuus, ISERA, PIONEER 4223,SANAY, Orobanche cumana, Süperoksit dismütaz, Peroksidaz, Antioksidantenzimler, Oksidatif stres.Hazırlanan bu Yüksek Lisans tezi Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi BAPtarafından 2005/27 numaralı projeden desteklenmiştir.v
  • Küçük Resim
    Öğe
    The effect of salt stress on Arabidopsis thaliana and Phelipanche ramosa interaction
    (Wiley, 2013) Demirbaş, Sefer; Vlachonasios, K. E.; Acar, Okan; Kaldis, A.
    Salinity and Orobanche or Phelipanche spp. infection are important crop stress factors in agricultural areas. In this study, we investigated the effect of salt stress on Phelipanche ramosa seed germination and its attachment onto Arabidopsis thaliana roots. We also evaluated the effect of both stresses on the expression of genes regulated by abiotic and biotic stresses. According to our results, high concentration of NaCl delayed P.ramosa seed germination in the presence of a strigolactone analogue (GR24). A similar pattern was observed in the presence of A.thaliana plants. Furthermore, we found that salt-treated A.thaliana seedlings were more sensitive to P.ramosa attachment compared with the untreated plants, indicating that there was a positive correlation between salt sensitivity and the ability of P.ramosa to infect A.thaliana plants. At the molecular level, a synergystic effect of both salt and P.ramosa stresses was observed on the cold-regulated (COR) gene expression profile of treated A.thaliana seedlings. Our data clarify the interaction between parasitic plants and their hosts under abiotic stress conditions.