Yazar "Çetin, Selçuk" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 4 / 4
  • [ X ]
    Öğe
    Biçim sonrası kuraklık stresine maruz bırakılan yaygın yonca (Medicago sativa L.) genotiplerinde kuraklık stresine tolerantlığı sağlayan bazı spesifik genlerin ifade seviyelerinin belirlenmesi
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2021) Çetin, Selçuk; Tiryaki, İskender
    Bu çalışma TÜBİTAK-TOVAG 116O417 numaralı proje kapsamında aseptik şartlarda kurağa tolerantlığı tespit edilen ve saksılarda kontrollü koşullarda yetiştirilen 3 farklı mutant (M3) yonca genotipinin birinci biçim sonrasında kuraklık stresine verdikleri tepkilerin kuraklık stresine karşı tolerantlıktan sorumlu lokus spesifik (MsProDH ve MtRD2) genlerin ifade seviyelerinde meydana getirdiği değişimlerin belirlenmesi amacıyla 2017-2020 yılları arasında Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü, Bitki Moleküler Genetik ve Biyoteknoloji Laboratuvarı'nda yürütülmüştür. Çalışmada ayrıca biçim öncesi (0. gün), kuraklık stresinin 18. ve 24. günü bazı agro-morfolojik özelliklerin yanı sıra bitki kanopy sıcaklığı ve total klorofil miktarları da incelenmiştir. Biçim sonrası uygulanan kuraklık stresinin 0, 18 ve 24. günlerinde alınan yaprak örneklerinden total RNA'lar izole edilmiş ve ardından cDNA'lar sentezlenmiştir. Çalışmada Ms18S rRNA geni RT-qPCR analizlerinde referans gen (RG) olarak kullanılmıştır. Her bir genotipe ait örneklerin RT-qPCR analizleri 3 teknik tekrar ile gerçekleştirilmiştir. Kuraklık stresine karşı tolerantlıktan sorumlu lokus spesifik genlerin ifade seviyeleri 2-??Ct metodu kullanılarak hesaplanmıştır. Bitki kanopy sıcaklığı ve total klorofil miktarlarına ait veriler SAS istatistik paket programı kullanılarak varyans analizine tabi tutulmuş, ortalamalar en küçük asgari fark (LSD) %5 önemlilik seviyesinde test edilmiştir. Çalışmada kullanılan X18, X20, X50 mutant bitkiler ile Z1 (sulu) ve Z2 (susuz) kontrol bitkilerinin MsProDH relatif gen ifade seviyeleri kuraklık stresinin 18. gününde sırasıyla 0,81, 4,57, 14,80, 0,19, 20,65 olurken 24. günde sırasıyla 0,19, 0,26, 1,78, 4,20, 49,56 olarak belirlenmiştir. X18, X20, X50, Z1 ve Z2 bitkilerinin MtRD2 relatif gen ifade seviyeleri kuraklık stresinin 18. gününde sırasıyla 0,28, 6,48, 14,84, 0,96, 1,23 olurken 24. günde sırasıyla 0,13, 0,25, 3,63, 5,33, 2,34 olarak belirlenmiştir. X18, X20, X50, Z1 ve Z2 bitkilerinin total klorofil miktarları 0. günde sırasıyla 58,48, 60,27, 65,55, 70,88, 58,08 mg/kg, 18. günde sırasıyla 48,66, 53,98, 56,96, 38,95, 46,05 mg/kg ve 24. günde sırasıyla 53,41, 49,22, 45,67, 46,21, 47,69 mg/kg olarak tespit edilmiştir. Varyans analiz sonuçları birinci biçim sonrası kuraklık stresine maruz kalan mutant ve kontrol yonca bitkilerinde incelenen agro-morfolojik ve fizyolojik özellikler bakımından önemli farklılıkların olduğunu göstermiştir. Sonuçlar birinci biçim sonrası uygulanan kuraklık stresinin, kuraklık stresinin süresi ve bitki genotipine bağlı olarak ilgili lokus spesifik genlerin relatif ifade seviyelerinde büyük değişikliklere neden olduğunu ve mutant bitkilerin kuraklık stresini daha iyi tolere edebildiğini göstermiştir. Anahtar sözcükler: Yaygın yonca, Kuraklık stresi, Gen ifadesi, Gerçek zamanlı kantitatif PCR
  • Küçük Resim
    Öğe
    Comparative Analysis of Alfalfa Mutants in Response to Drought Stress Applied After First Cutting
    (Springer, 2024) Çetin, Selçuk; Tiryaki, İskender; Sarı, Uğur; Acar, Okan
    The purpose of this study was to determine the agro-morphological, physiological, and transcriptional characteristics of ethyl methane sulfonate (EMS)-mutagenized M3 alfalfa (Medicago sativa L.) mutants grown for 24 days under water deficit conditions following the first cutting at the blooming bud stage. Drought stress generally reduced all agro-morphological parameters measured. Cutting stress significantly reduced total chlorophyll contents of all genotypes, with the exception of mutant X20. Significant changes occurred in the levels of ascorbate peroxidase (APX), lipid peroxidation (TBARS), glutathione reductase (GR), superoxide dismutase (SOD) and crude protein levels. Drought stress considerably elevated GR levels in irrigated control (C1) and unirrigated control (C2) plants. In contrast to the other genotypes studied, mutant X20's crude protein level increased significantly after the first cutting under 24 days of water deficit conditions, compared to the level found before cutting. The expression profiles of Medicago truncatula Response to Desiccation 2 (MtRD2) and Medicago sativa proline dehydrogenase (MsProDH) genes differed based on the plant genotype and duration of drought stress. Drought stress increased MsProDH gene expression in X20, X50, and C2 plants by 4.57, 14.8, and 20.65 times, respectively. The findings of the expression study indicated that the MtRD2 gene may play a key role in stress reduction rather than drought stress per se. The results of this study revealed that cutting and drought are two independent stress variables that should be evaluated separately when evaluating genotype response to both irrigated and unirrigated growing environments in alfalfa.
  • [ X ]
    Öğe
    Counting and Classification of Seed Using Machine Learning Methods
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2022) Çetin, Selçuk; Nar, Hakan; Kızıl, Ünal
    Deep learning, machine learning and image processing techniques have become important tools used in facilitating agricultural work and developing solutions to different problems in the production phase. In this study, a seed number and type detection algorithm was developed using YOLO deep learning architecture, a real-time object detection algorithm employing the CNN structure in AugeLab Studio sofware. With the developed model average loss factor of 0.417 was achieved after 3000 iterations. As a result of the analysis, it has been determined that the bean classification accuracy varies between 97% and 100%, while the chickpea classification accuracy varies between 91% and 100%. In addition, the total number of 11 beans and 10 chickpea seeds in a single image was determined with 100% accuracy. The results demonstrated that AugeLab, a software employing artificial inteligence based image processing techniques, can be used by seed production companies, agricultural biotechnology laboratories and seed certification institutions in counting and classification of seeds. It can also be used in variety and/or species separation, separating and detecting germinated seeds, or detecting and proportioning foreign mixtures in seed certification processes within shorter time and less costs
  • [ X ]
    Öğe
    Determination of Paddy Rice Parcels from RGB Satellite Images Using Image Processing Techniques
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2022) Nar, Hakan; Çetin, Selçuk; Kızıl, Ünal; Çamoğlu, Gökhan
    The remote sensing technique is of great importance in agriculture in determining vegetation cover, monitoring its development, classification, and yield estimation. Various sofwares, mathematical algorithms, and statistical approaches are used to make satellite images meaningful in remote sensing. In this study, it is aimed to determine the rice plant plots and areas by using the Augelab Studio sofware, which is a new approach in artificial intelligence-supported image processing techniques. Using the RGB image covering an area of 2.5 km2 obtained from Google Earth Pro, the classification of paddy rice fields and the calculation of these areas were made. Rice fields from parcels with different plant patterns were separated using Augelab Studio artificial intelligence image processing software using filtering blocks. The real areas of the other rice parcels were determined by the coefficient created by taking the pixel area values of some of the parcels whose total area is known as a reference. It is found that total areas of rice parcels in Augelab Studio and Google Earth Pro programs to be 798 and 801 decares, respectively. It has been observed that the areas of the paddy rice parcels can be determined with high accuracy by using Augelab Studio