Yazar "Çördük, Nurşen" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 13 / 13
  • [ X ]
    Öğe
    Assessment of nuclear abnormalities in erythrocytes of balkan pond turtle mauremys rivulata (Valenciennes, 1833) (Testudines: Geoemydidae) from the Biga Stream, Çanakkale, Turkey
    (Bulgarian Academy of Sciences, 2019) Çördük, Nurşen; Hacıoğlu Doğru, Nurcihan; Gül, Çi?dem; Tosunoğlu, Murat
    Reptilian species are potentially efficient bioindicators of pollution and habitat destruction. Turtles may be especially useful for monitoring the chemical contamination of their habitats. The aim of this study was to assess the genotoxic effect of environmental pollutants on Balkan pond turtle Mauremys rivulata (Valenciennes, 1833) from the Biga Streamp Canakkale, Turkey. Healthy mature animals were collected using the hand-capture method from four stations: Estuary zone, city centre, buffer zone and industrial zone of the stream. Blood samples of live specimens were obtained in within one day of their capture. The peripheral blood smears for each specimen were prepared, fixed with methanol for 15 min and dyed with Giemsa stain. Micronuclei and other nuclear abnormalities such as blebbed, kidney-shaped, lobed and notched nuclei were identified. Comparing the nuclear abnormalities in the samples, it was determined that their frequency was highest in the samples collected from the station in the city centre (9.16±0.02). The results indicated that the levels of genotoxic pollutants in different regions of the Biga Stream lead to DNA damage in Mauremys rivulata. © 2019 Bulgarian Academy of Sciences. All rights reserved.
  • [ X ]
    Öğe
    Assessment of the genetic stability of indirect shoot organogenesis-derived plantlets of digitalis trojana ivanina by flow cytometry and cytological analyses
    (Namik Kemal University - Agricultural Faculty, 2017) Çördük, Nurşen; Yücel, Gülru; Akinci, Nihan; Tuna, Metin
    In this study, flow cytometry and cytological analysis was used to evaluate the genetic stability of Digitalis trojana Ivanina plants regenerated via indirect shoot organogenesis. For in vitro propagation, leaf explants were excised from seedlings grown in sterile conditions and cultured MS medium supplemented with 3.0 mg/L BA + 0.1 mg/L NAA. Shoots and calli were subcultured for a period of 2 weeks for shoot multiplication. For rooting, shoots were separated individually and transferred to MS medium containing 0.1% activated charcoal. Genetic stability of the regenerated plants was assessed by flow cytometry and cytological analyses. Flow cytometric analysis revealed that regenerated plantlets has as 2.80±0.03 pg nuclear DNA (2C) and seed-derived plants has on average 2.80±0.1 pg/2C. Cytological analysis showed that regenerated plantlets have the same number of chromosome with seed-derived plantlets of D. trojana (2n=56). Our results have showed that the plantlets propagated in MS medium with 3 mg/L BA + 0.1 mg/L NAA did not differ genetically from donor plants. Therefore, this system can be effective and suitable for clonal propagation of D. trojana. Our results also confirmed that flow cytometry is fast, easy, accurate and relatively cheap method to determine ploidy of in vitro propagated D. trojana plantlets. © 2017 Namik Kemal University - Agricultural Faculty. All Rights Reserved.
  • [ X ]
    Öğe
    Cardenolides in digitalis trojana ivanina, an endemic plant of ida mountain, Turkey
    (2013) Çördük, Nurşen; Aki, Cüneyt
    Cardiac glycosides are used as positive inotropic agents in the treatment of heart rhythm disorders. Digitalis species have been used as a source of these components for many years. Digitalis trojana Ivanina is an endemic plant of Ida Mountain (Kazdagi{dotless}), Çanakkale, Turkey. In this study, we report the cardenolide content changes of Digitalis trojana Ivanina which was collected from Kazdagi{dotless} at different altitudes (836m, 961m, 1041m and 1191 m). The content of lanatoside C, digoxin, digitoxin and gitoxigenin in the plant samples were analysed by HPLC. According to the results of analyses, cardenolide contents of D. trojana (lanatoside C, digoxin, digitoxin and gitoxigenin) showed variations by altitude (836m, 961m, 1041m and 1191 m) and month (May and July). It was determined that these cardenolides were higher in plants collected in July than in May and the highest cardenolide concentration was found in the samples collected at 1047 m. both in May and July.
  • [ X ]
    Öğe
    DETERMINATION OF NUCLEAR DNA CONTENT AND CHROMOSOME NUMBER OF VERBASCUM SCAMANDRI MURB. (SCROPHULARIACEAE)
    (2023) Yücel, Gülru; Cambaz, Ebru; Çördük, Nurşen
    The study aimed to determine the chromosome number and nuclear DNA content of an endemic plant, Verbascum scamandri, using 14-week-old plants germinated from seed and to determine the genetic stability based on flow cytometry analyses in callus tissue induced MS medium containing 1 mg/L Kin + 1 mg/L 2,4-D and 9-week-old propagated plants, induced and developed on MS medium containing 2 mg/L Kin + 0.1 mg/L 2,4-D. In the mitotic chromosome counts showed that V. scamandri had 2n = 32 chromosome number. Flow cytometric analysis revealed that 14-week-old in vitro grown plants have 0.73 pg/2C ± 0.01, callus tissue has 0.76 pg/2C ± 0.02 and propagated plantlets have 0.79 pg/2C ± 0.01. The results proved that propagated plants had similar DNA content to the seed-derived plants which showed analysed plants were genetically stable.
  • [ X ]
    Öğe
    Effects of dodine on total protein content and peroxidase activity in Vicia faba L.
    (2016) Çördük, Nurşen; Akıncı, Nihan; Kaya, Nergis; Yücel, Gülru; Akı, Cüneyt
    Bu araştırmada dodin fungusitinin Vicia faba L. fizyolojisi üzerindeki etkisi, total protein miktarı ve peroksidaz (POX) aktivitesi aracılığıyla değerlendirilmiştir. Bu doğrultuda, dört haftalık V. faba fideleri 0.04 mL/L, 0.08 mL/L ve 0.16 mL/L'lik dodin konsantrasyonları ile muamele edilmiştir. Bu işlemlerden sonra bitki örneklerinin yaprakları 24, 48 ve 72 saat ara ile hasat edilmiştir. Yapılan analizler sonucunda, artan dodin konsantrasyonu ve muamele süresiyle total protein miktarı kontrole göre önemli ölçüde azalırken, peroksidaz aktivitesi yükselmiştir. Elde edilen sonuçlar dodinin bitki savunma sistemini uyardığını göstermiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    Erythrocytic and Nuclear Abnormalities in Natrix sp. from the Biga Stream (Çanakkale, Türkiye)
    (ABADER (Adıyaman Bilimsel Arastırmalar Dernegi), 2024) Çördük, Nurşen; Boran, Begüm; Baycan, Bengi; Uysal, İbrahim
    The Grass Snake (Natrix natrix) and the Dice Snake (Natrix tessellata) are potential bioindicator water snake species in certain aquatic habitats. The aim of this study is to evaluate the frequency of erythrocytic abnormalities, immature erythrocyte index, and nuclear abnormalities in Natrix natrix and Natrix tessellata from Biga Stream in Çanakkale, Türkiye. Erythrocytic abnormalities and nuclear abnormalities such as micronuclei, lobbed nuclei, notched nuclei, blebbed nuclei, and binucleate cells were observed in peripheral blood smears for each sample. According to our results, total erythrocytic abnormalities in N. natrix (3.01±0.55%) were higher than in N. tessellata (2.52±0.32%). Similarly, the frequency of total nuclear abnormalities in N. natrix (13.40±2.7%) was higher than in N. tessellata (12.68±5.81%) but there was no statistically significant difference in total erythrocytic and nuclear abnormalities. However, student's t-test revealed that there was a statistically significant difference between the two species only in terms of immature erythrocyte index (p: 0.008) which was higher in N. natrix. Due to the results, it was suggested that N. natrix may exhibit more physiological responses to envirenmental stress factors. © 2024, ABADER (Adıyaman Bilimsel Arastırmalar Dernegi). All rights reserved.
  • [ X ]
    Öğe
    Evaluation of the Effects of Environmental Pollutants on Populations of the European Pond Turtle Emys orbicularis (Linnaeus, 1758) (Testudines: Emydidae) at Çanakkale, Türkiye
    (Institute of Biodiversity and Ecosystem Research - Bulgarian Academy of Sciences, 2024) Çördük, Nurşen; Gül, Çiğdem; Hacıoğlu Doğru, Nurcihan; Tosunoğlu, Murat
    We evaluated and compared the effects of different environmental pollutants on haematological, microbiological and genotoxic characteristics of populations of the freshwater turtle Emys orbicularis from the Kavak Delta and Dardanos in Çanakkale (NW Türkiye). The haematocrit values of samples of E. orbicularis differed considerably between the two localities: they were higher in the Kavak Delta samples. The mean cell haemoglobin concentration was also significantly different between the two localities (higher in the samples of the Dardanos). The water samples of the two localities were within the limit (Class I-II) for all parameters, except Dardanos temperature (Class III). Although it was not statistically significant, the nuclear abnormality formation in the erythrocytes of the sample from Dardanos was numerically higher than that from the Kavak Delta. The study assessed the impact of pollutants on populations of Emys orbicularis and conducted on-site evaluations and monitoring of genotoxic pollution. © 2024 Institute of Biodiversity and Ecosystem Research - Bulgarian Academy of Sciences. All rights reserved.
  • [ X ]
    Öğe
    In vitro çoğaltılan ve doğal ortamda yayılış gösteren Digitalis trojana Ivan. türünde progesteron 5ß-reduktaz gen ifadesinin ve kardenolid üretiminin karşılaştırılması
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2012) Çördük, Nurşen; Akı, Cüneyt
    Bu tez çalışmasında, Kazdağı endemik bitkisi ve tıbbi öneme sahip olan Digitalis trojana Ivan. türününün Mayıs ve Temmuz aylarında Kazdağından farklı yüksekliklerinden toplanan bitki örneklerinde ve in vitro üretilen bitki örneklerinde ß-kardenolitlerin biyosentezinde kilit role sahip progesteron 5ß-reduktaz geninin ifadesi belirlenmiş ve karşılaştırılmıştır.Çalışmada ayrıca Digitalis trojana türünün in vitro çoğaltımı gerçekleştirilmiştir. Bitkinin yaprak eksplantlarından sürgün rejenerasyonunun 0,1 mg/l NAA ve 3 mg/l BAP içeren MS ortamında meydana geldiği ve bu ortamın türün kısa sürede etkili bir şekilde in vitro çoğaltımı için kullanılabilir olduğu belirlenmiştir.Ayrıca bitki örneklerinin taban yapraklarındaki kardenolitlerin katı faz ekstraksiyonu yapılmış ve örneklerdeki lanatosit C, digoksin, digitoksin ve gitoksigenin miktarları HPLC ile belirlenmiştir. HPLC analizi sonucunda Temmuz ayında toplanan bitki örneklerindeki kardenolit içeriklerinin (?g/g KA) Mayıs ayında toplanan bitki örneklerinin içeriklerinden daha yüksek olduğu belirlenmiştir. Ayrıca bitkilerdeki kardenolid içeriklerinin yüksekliğe göre değiştiği belirlenmiştir. Yapılan analiz sonucunda in vitro üretilen bitkilerden sadece 1 mg/l NAA ve 5 mg/l BAP içeren MS besin ortamında üretilen 12 haftalık bitkilerde lanatosit C (10,288 ?g/g KA) ve digoksin (2,068 ?g/g KA) tespit edilebilmiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    In vitro Üretilen Digitalis Trojana Ivanina Bitkilerinin Genetik Kararlılığının Flow Sitometri ve Sitolojik Analizler ile Değerlendirilmesi
    (2017) Çördük, Nurşen; Yücel, Gülru; Akıncı, Nihan; Tuna, Metin
    Bu çalışmada, Digitalis trojana Ivanina türüne ait dolaylı sürgün organogenezis ile üretilen bitkilerin genetik kararlılığı flow sitometri ve sitolojik analizler ile değerlendirilmiştir. İlk aşamada yaprak eksplantları 3 mg/L BA + 0,1 mg/L NAA içeren MS besin ortamında kültüre alınmıştır. Bu ortamda dolaylı organogenez yoluyla oluşan sürgünler 2 haftada bir altkültüre alınarak çoğaltılmıştır. Bitkiler % 0.1 aktif karbon içeren MS besin ortamında köklendirilmiştir. Üretilen bitkilerin genetik kararlılığı flow sitometri ve sitolojik analizler ile tohumdan yetiştirilen D. trojana bitki örnekleri ile karşılaştırılarak değerlendirilmiştir. Flow sitometri analizinde, in vitro üretilen bitki örneklerinin DNA içeriği 2.80±0.03 piko gram, tohumdan yetiştirilen bitki örneklerinin DNA içeriği ise 2.80±0.1 piko gram belirlenmiştir. Bitkinin mikroskop ile yapılan mitoz kromozomu sayımlarında kromozom sayısının 56 olduğu ve in vitro üretilen bitkilerin kromozom sayısında bir değişiklik olmadığı belirlenmiştir. Yapılan analizler sonucunda 3 mg/L BA + 0,1 mg/L NAA içeren MS besin ortamında üretilen bitkilerde genetik farklılık görülmemiştir. Yapılan bu çalışma ile D. trojana türünün ilk kez DNA içeriği ve kromozom sayısı belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, türün in vitro kültüre alınması sırasında kültür koşullarından dolayı meydana gelebilecek olan genetik varyasyonların analizinde flow sitometrinin kullanılabileceğini göstermektedir.
  • [ X ]
    Öğe
    KARBAZOL İÇEREN YENİ TÜR FOSFAZEN BİLEŞİKLERİNİN SENTEZİ, KARAKTERİZASYONU, DNA İLE ETKİLEŞİM VE SİTOTOKSİK AKTİVİTE ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ
    (2019) Çıralı, Diğdem Erdener; Çördük, Nurşen
    Fosfazenler, -N=PX2- grubu içeren kimyasal bileşiklerdir. Bir başka deyişle, fosfazenler fosfor atomunun azot atomuna çifte bağla ve diğer u?ç atoma tekli bağla kovalent olarak bağlandığı bileşiklerdir. Bu grubun moleku?lde tekrar edilmesi ile oluşan, halkalı veya du?z zincirli yapıda olabilen bileşikler inorganik moleku?llerin en dikkat çekici sınıflarından birini oluşturmaktadır. Fosfazenler ile ilgili çalışmalar, bazı ileri teknoloji malzemelerinin temelini oluşturmalarından dolayı hız kazanmıştır. Fosfazenlerin fosfor atomu u?zerinde bulunan klor atomlarının çeşitli gruplar ile nu?kleofilik yer değiştirme reaksiyonu sonucu değişik fosfazen bileşikleri meydana gelir. Bazı önemli fosfazen bileşikleri endu?stri, askeri ve tıbbi alanlarda kullanılmaktadır. Fosfazen tu?revleri pek çok fiziksel ve biyolojik özelliklere sahiptir. Likit kristallerde, yanmaya dayanıklı malzemelerde, elektrolit olarak tekrar şarj edilebilir bataryalarda kullanım alanı olduğu gibi oldukça gu?çlu? antimikrobiyal, antibakteriyal ve antitu?mör aktivitelere sahiptirler. Karbazol, pirol halkasının her iki tarafına altı u?yeli benzen halkasının kaynaşması ile oluşmuş trisiklik yapıya sahiptir. İlginç yapısal özellikleri ve gelecek vaat eden farmakolojik aktiviteleri karbazol kimyasında oldukça önemli gelişmelere yol açmıştır. Bu proje kapsamında ilk olarak termal bozunmaya ve hidrolize karşı hekzaklorosiklotrifosfazenden daha dayanıklı olan 2,2’-dihidroksibifenil grubu içeren siklofosfazen bileşikleri sentezlendi ve bu bileşiklerin karbazol tu?revi ile reaksiyonu sonucu elde edilen yapıları element analizi, IR, 1H-NMR, 13C-NMR, 31P-NMR spektrum verilerinden yararlanılarak aydınlatıldı. Sentezlenmesi planlanan yeni tu?r fosfazen bileşiklerinin DNA ile etkileşiminin belirlenmesi için agaroz jel elektroforezi ve restriksiyon enzim kesimi analizleri yapıldı. Son olarak bu bileşiklerin çeşitli kanser hu?creleri u?zerindeki sitotoksik aktiviteleri belirlendi.
  • [ X ]
    Öğe
    Nicotiana tabacum L. (tütün)'da in vitro rejenerasyon sistemlerinin geliştirilmesi
    (Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, 2007) Çördük, Nurşen; Akı, Cüneyt
    Çalışmamızda, Nicotiana tabacum L. cv. Samsun (tütün)'un in vitro rejenerasyon sistemleri geliştirilmiştir. Bu doğrultuda, farklı Nicotiana tabacum L. cv. Samsun (tütün) eksplantlarından organogenesis gerçekleştirilmiştir. Yaprak eksplantından organogenesis indirekt, gövde eksplantından ise direkt yolla meydana getirilmiştir. Organogenesisin indirekt yolla gerçekleşmesi için yaprak eksplantları, önce farklı oranlarda NAA ve BAP ilave edilmiş MS içeren kallus teşvik ortamlarına aktarılmıştır. Bu ortamlarda meydana gelen kallus dokuları karşılaştırılarak, en iyi kallus teşvik ortamı olarak 2,0 mg/L NAA ve 0,2 mg/L BAP içeren ortam belirlenmiştir. Seçilen kallus dokusu alt kültürlemeler ile çoğaltılmıştır. Çoğaltılan kallus dokusundan sürgün rejenerasyonu 2,0 mg/L BAP, 0,5 mg/L NAA ilave edilmiş MS ortamında meydana gelmiştir. Bu sürgün rejenerasyon ortamında eksplant başına düşen sürgün sayısı 2,05 olarak hesaplanmıştır. Gövde eksplantından sürgün oluşumu ise 2,0 mg/L NAA ve 0,2 mg/L BAP ilave edilmiş ortamda meydana gelmiştir ve eksplant başına düşen sürgün sayısı 7 olarak hesaplanmıştır. Her iki yolla organogenesisi gerçekleştirilen sürgünler, bitki büyüme düzenleyicileri içermeyen ortamda (MS0) devam eden alt kültürlemeler yolu ile köklendirilmiştir. In vitro koşullarda yaprak ve gövde eksplantlarından rejenerasyon sonucu elde edilen tam bitkilerin son aşamada, toprağa aktarılarak dış ortama alışmaları sağlanmıştır. Çalışmamız sonunda, rejenerasyon sonucu elde edilen bütün bitkilerin dış ortama uyum sağladıkları ve sağlıklı bir şekilde büyüdükleri gözlenmiştir. Anahtar Kelimeler: Nicotiana tabacum, in vitro, bitki büyüme düzenleyicileri, kallus, rejenerasyon.
  • [ X ]
    Öğe
    Prevalence of Haemogregarina stepanowi and Assessment of Some Risk Factors in Mauremys rivulata (Valenciennes, 1833) Freshwater Turtles (Testudines: Geoemydidae)
    (Galenos Publishing House, 2023) Ceylan, Onur; Gül, Çiğdem; Çördük, Nurşen; Doğru, Nurcihan Hacıoğlu; Tosunoğlu, Murat
    Objective: The Balkan terrapin, Mauremys rivulata, is a freshwater turtle. This reptile is exposed to many environmental pollutants and some infectious agents, including Haemogregarina stepanowi parasite. This study was conducted to determine the microscopic prevalence of haemogregarine infection in M. rivulata caught in three different localities (Bozcaada, Gökçeada, and Dardanos) in Çanakkale province of Turkey, and assessment of some risk factors. Methods: Twenty-four blood samples were collected, thin blood smears were prepared, and the presence of haemogregarine parasites microscopically was screened. Water samples were also taken from the habitats, and these samples were analyzed physiochemically and microbiologically. Results: Morphological identification was made by detecting the sausage-shaped intra-cytoplasmic developmental stages of H. stepanowi, and thirteen of twenty-four turtles (54.2%) were found to be infected. The prevalence of H. stepanowi was detected as the highest (90.0%) in the Gökçeada district, where the water pollution is higher than in the other localities. A statistically significant relationship was observed between the distribution of the infection and the gender of the turtles, the temperature of the water, the number of faecal coliforms in water and the amount of dissolved oxygen in the water. A statistically significant difference was found between the localities in terms of the prevalence of H. stepanowi infection, and the infection was primarily detected in the Gökçeada district. Conclusion: This study has significance in providing information regarding haemoparasitic diseases of freshwater turtle, M. rivulata, in Turkey. © 2023 Turkish Society for Parasitology.
  • [ X ]
    Öğe
    Taxonomic status of a newly described island population of the smooth newtLissotriton vulgaris (Linnaeus, 1758) from Bozcaada (Çanakkale, Turkey)
    (2017) Çördük, Nurşen; Gül, Çiğdem; Tosunoğlu, Murat; Sotıropoulos, Konstantinos
    The taxonomic status and phylogenetic position of the recently recorded smooth newt (Lissotriton vulgaris) population from the island of Bozcaada (Çanakkale, Turkey) is clarified on the basis of morphological and molecular phylogenetic analyses. The L. vulgaris population from Bozcaada presents body proportions and morphological features of subsp. schmidtlerorum, such as small body length, absence of the tail filament, and dorsal crest with pointed free margin. Similarly, phylogenetic analyses of mitochondrial DNA sequences (ND4, 16S rRNA) place the Bozcaada population within Clade E of the recent L. vulgaris phylogeny, which consists of L. v. schmidtlerorum populations.