Korkmaz, Savaş2025-01-272025-01-272018https://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/618062https://hdl.handle.net/20.500.12428/1458115.08.2018Citrus chlorotic dwarf associated virus (CCDaV) ülkemizde 1980?li yılların sonunda ortaya çıkmıştır. Virüsün ülkemizdeki varlığı sadece Doğu Akdeniz Bölgesinden (DAB) bildirilmiş olup, diğer önemli turunçgil üretim bölgelerindeki varlığına yönelik herhangi bir çalışma yapılmamıştır. Bu amaçla Türkiye?nin 4 farklı turunçgil üretim bölgelerinde ticari, rekreasyon, ev, otel vb. gibi bahçelere tesadüfi sörveyler düzenlenmiştir. Bitkiler görsel olarak incelenmiş, CCDaV benzeri belirti gösteren bitkilerden örnekler alınmıştır. Gerçekleştirilen CCDaV enfeksiyonu tanılama çalışmalarında Antalya ilinde bir otel bahçesindeki turunçgillerde bizim bilgilerimize göre ilk kez DAB dışında CCDaV enfeksiyonu tespit edilmiştir. Ancak ticari olarak turunçgil yetiştiriciliği yapılan alanlarda ise CCDaV enfeksiyonu tespit edilmemiştir. CCDaV izolatlarının populasyon yapılarının moleküler özelliklerinin belirlenmesi amacı ile 25 CCDaV izolatının CP (kılıf protein; coat protein) genine göre moleküler karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. CCDaV izolatlarının nükleotit ve amino asit düzeyinde kendi içlerinde ve Çin izolatları ile %98'in üzerinde benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Filogenetik analizler sonucunda ise Çin ve Türk izolatlarının birbirinden ayrılma eğiliminde olduğu görülmüştür. CCDaV izolatlarının tüm genom dizilimlerinin belirlenmesi amacı ile 6 farklı CCDaV izolatı kullanılmıştır. CCDaV izolatlarının tüm genom dizilimleri ortaya çıkarılarak, benzerlik ve filogenetik analizleri gerçekleştirilmiştir. Ayrıca, bu analizler sonucunda CCDaV izolatların birbirleri ile yüksek seviyede sekans homolojisi gösterdiği tespit edilmiştir. Ayrıca gerçekleştirilen bu çalışma kapsamında CCDaV'nin farklı doku ve mevsimsellerdeki konsantrasyon değişimlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Dört mevsim boyunca CCDaV ile enfekteli olduğu tespit edilen bir limon ağacından mevsim ortalarında farklı doku ve kısımlarından örnekler alınarak CCDaV varlığı ve konsantrayon değişimleri real time PCR (qPCR) ile araştırılmıştır. Gerçekleştirilen qPCR çalışmaları sonucunda; CCDaV varlığı yaprak, çiçek ve meyvede tespit edilmiştir. Ayrıca, CCDaV'nin farklı mevsim ve yönlerdeki konsantrasyon değişimleri arasında dikkate değer bir farklılık bulunmamıştır. Bu sonuçla rutin CCDaV enfeksiyon sörveylerinin yılın herhangi bir zamanın da yaprak örneklerinden yapılabileceği belirlenmiştir.trinfo:eu-repo/semantics/openAccessBahçe BitkileriMikrobiyolojiBiyoteknoloji ve Uygulamalı MikrobiyolojiVirolojiBiyokimya ve Moleküler BiyolojiTURUNÇGİL KLOROTİK CÜCELEŞME İLE İLİŞKİLİ VİRÜSÜN (Citrus Chlorotic Dwarf associated Virus; CCDaV) ETİOLOJİSİ VE MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONUProject053618062