Kuzey-Batı Anadolu Bölgesi Tütün Üretim Alanlarında Tobacco Mild Green Mosaic Virus İzolatlarının Genetik Çeşitliliğinin Belirlenmesi

Genellikle insan saglıgına olumsuz etkileri ile sıklıkla gündeme gelen tütün, özellikle Türkiye'de kurak alanlarda tarım yapılmasına imkan vermesinden dolayı oldukça önemli bir bitkidir. Kültürü yapılan tüm bitkilerde oldugu gibi virüs hastalıkları tütün üretimini sınırlandıran en önemli biyotik hastalıklardan birini olusturmaktadır. Ancak hem Türkiye'de hem de dünyada diger ekonomik önemi olan bitki türlerine göre tütün virüs hastalıkları ile ilgili yapılan çalısmalar sınırlı sınırlıdır. Ayrıca son yıllarda Türkiye'deki tütün üreticilerinin virüs epidemilerinden dolayı oldukça büyük kayıplar yasadıgı da bilinmektedir. Bu sebepler ile Kuzey-Batı Anadolu bölgesi tütün üretim alanlarında arazi çalısmaları gerçeklestirilerek, virüs ve virüs benzeri simptom gösteren 300 bitkiden örnekler alınmıstır. Alınan örnekler tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) enfeksiyonu açısından RT-PCR ile testlenmistir. Testlemeler sonucunda örneklerin 246 tanesinde TMGMV enfeksiyonu tespit edilmistir. Enfekteli örnekler içerisinden elde edildikleri cografik orijinler temel alınarak 10 izolat ileri analizler için seçilmisir. Seçilen izolatların tüm genom dizilimleri belirlenmistir. Elde edilen bu veriler çoklu dizi karsılastırmaları ve filogenetik analizlerde kullanılmıstır. Gerçeklestirilen çoklu dizi karsılastırmaları sonucunda Türk TMGMV izolatlarının kendi içlerinde ve dünya izolatları ile yüksek sekans homolijsine sahip oldugu belirlenmistir. Gerçeklestirilen filogenetik analizler sonucunda ise Türk ve dünya TMGMV izolatlarının genel olarak birbirleri ile yakın iliskili olarak bulunmasının yanı sıra olusturulan filogenetik agaçların büyük bir kısmında iki büyük alt grup olusumu belirlenmistir. Ayrıca TMGMV izolatlarının filogenisinde konukçu ve cografik orijinlere özellesme tespit edilmemistir. Gerçeklestirilen bu çalısma ile Kuzey-Batı Anadolu bölgesi tütün üretim alanlarında TMGMV enfeksiyonunun oldukça yaygın oldugu ve genetik olarak izolatların birbirleri ile oldukça yakın iliskili oldugu bulunmustur.